每逢案件搜索都状况百出的警视厅搜索一课刑警—–南波阳人（田中直树）在某一天，被搜索一课长五十岚修（武田铁矢）给叫了过去原来此前，南波的母校帝都大学法学系教授曾受托担任《立功搜索百年史》的编修但是上头却勒令中止制造，需求南波代为前往抱歉。南波边嚷嚷着“我不是为了做这种事才当的刑警”边心不甘情不愿地提着伴手礼前往帝都大学。没想到却在那碰到了预料之外的案件。下任校长候补人选的医学系教授—–高寺保的尸体在讲台上被发现了！而且高寺的尸体是从讲台天花上被吊上去，帷幕上布满了耐人寻味的数字暗号……在这谜团重重的案发现场，出现了一个颇感兴味地自言自语道“这个案件大有内情”的男人。原来他正是南波此行要拜见之人—–上知天文下知天文的文科天赋、别名“知识巨人”的宇野边叡古（藤木直人）。 南波所属的搜索一课立刻展开了搜索。却不料在案发现场发现了睿古常用的烟斗里的烟草！看来凶手是方案嫁祸于叡古……终究凶手的动机是什么，而又为什么要把叡古卷入案件当中呢？！试图解开案件隐情的睿古与助手阿苏藤太（白洲迅）共同末尾解读暗号。另一方面，搜索一课把副校长—–户村麻美（浅野百合子）及与被害者争夺下任校长之位的几个相关者视为嫌犯，但搜索依然难有停顿。 为了尽早处置案件，五十岚任命叡古为调查顾问。被搜索一课组长—–川添德治（宇梶刚士）吩咐盯着点的南波，处处跟叡古一同举动。这时期，帝都大学内发作了第二起教授遇害的案件！而且案发现场再次留下了不明所以的暗号……
