天庭无玄公主举办生日宴会，众位神仙纷纷献上各种宝贝，希望能够打动无玄公主，但是最终打动公主的却是医神吴夲的一枝梨花。吴夲雀屏中选，成为了无玄公主的驸马。食神秦大悲被人陷害，精心烹制献给玉帝的龙肝成为了不能吃的木炭，吴夲为了帮助秦大悲品尝了一下，认为看上去像是木炭的东西实际上非常好吃，要玉帝尝试，结果触怒了玉帝，被打入了太上老君的炼丹炉里面，其实太上老君的用意也是为了维护吴夲。瘟君带领大军入侵天界，打算夺取天庭，和托塔李天王展开激战。一片混乱之中食神和吴夲从炼丹炉里面逃了出来，发现无玄公主在天庭失踪了。吴夲被天庭的人误会要帮助瘟神破解了法阵，但是太上老君却认为吴夲另有用意。此时无玄公主忽然出现在法阵里面，以为吴夲是要帮助瘟君，吴夲连忙解释自己其实是为了对付瘟君。无玄公主的突然闯入让法阵出现了破绽，为了能够成功对付瘟君，无玄公主自愿被打落人间，成为凡人。法阵运行之时，吴夲也坠落人间。秦大悲为了找回无玄公主，自愿下凡去救公主。瘟君的亲信青竹为了寻找瘟君也来到了人间，还顺便救了秦大悲。秦大悲来到街上，和女贼鲍大银擦肩而过。鲍大银其实就是无玄公主的转世。鲍大银不小心被马车撞上，吴夲出手相救。盖仲景和徒弟楚练来到了燕城，燕城此时瘟疫横行，两人奉了朝廷的命令前来救治。吴夲把鲍大银送到了医馆里面救治，没想到鲍大银的腿断了，治疗费用昂贵，鲍大银一口咬定是吴夲把自己撞到的，吴夲目瞪口呆。吴夲和鲍大银扭打到了公堂之上，吴夲拿不出赔偿的银子，被关押了起来。为了控制瘟疫，候将军奉命封城。
吴夲被关押在了县衙的前面，吴夲告诉鲍大银这个伤势十分容易治疗，随后治好了鲍大银，鲍大银十分惊奇。而此时秦大悲也在纠结着怎么才能够让吴夲和无玄公主重新变成神仙。盖仲景决定命令御林军封城，防止瘟疫传播，燕城知县屠远得知以后十分震惊。屠远找到了吴夲，要求对方帮自己送一封信，结果送信的马车刚出城门就被盖仲景给乱箭齐发，射的像个刺猬一样。屠远十分慌张，以为自己全城性命不保。吴夲面见了盖仲景，谴责对方不应该为了扑灭瘟疫，不尝试医疗而是直接打算封城杀死所有的百姓。吴夲愤怒不已，决定自己回城治疗百姓。吴夲对知县屠远毛遂自荐，表示自己医术不错，希望能够尝试治疗瘟疫，屠远半信半疑。青竹撒谎表示冰火元魂能够让吴夲和无玄公主变成神仙，秦大悲听信了以后信以为真，打算取出冰火元魄。吴夲用自己帮助屠远送的信作为威胁，要屠远同意自己来主持大局，并且索要了五百两银子，作为治疗的费用。虽然肉痛，屠远还是同意了。鲍大银开心的在厨房里面做饭，可怜的吴夲成为了第一个试吃的对象，差点中毒身亡。师爷告诉知县屠远吴夲肯定是为了名利，他本身就是一个江湖骗子，不过是江湖郎中而已。鲍大银决定跟着吴夲学习医术，拜吴夲成为师父。但是实际上鲍大银却是看上了吴夲这个人，打算和对方交往。城中再次出现了瘟疫病死的患者，吴夲开始着急的调查病情。吴夲指出了知县家里挂的一幅画是假的，师爷力辩这是真的，随后吴夲给出了证据，师爷花了知县的八百两银子却买到一副假画，知县非常生气，痛骂师爷一顿，要师爷拿出八百两银子作为治疗的费用。
瘟疫已经死了十几个人，吴夲从知县那里得知这些人已经火化，心中起了怀疑，决定要了这十几人的资料调查清楚。吴夲正在看户籍资料，此时鲍大银打算帮助对方做衣服，一直在旁边捣乱。吴夲和鲍大银贴的很紧，大夫谢万山还以为两个人在亲热。吴夲得知有病人疫情发作，当即决定前去看诊，没想到路上鲍大银的脚差点扭到，还打算和吴夲亲热，吴夲十分尴尬，连忙离开。吴夲诊治以后发现病人的病情并无大碍，随后施加针灸治疗。就在此时吴夲听到了锣响声，得知自己的房间着火了。吴夲回到了房间，发现一切都烧成灰烬，户籍资料也失踪不见了。吴夲当即产生了怀疑，认为这场瘟疫很有可能是假的，死人的真正原因有可能是谋杀案。吴夲找到了知县屠远，告诉对方很有可能这是几个人都是因为中毒身亡的，这种毒药发作起来和瘟疫很像，并且只有眼睛不同。先前的十几个人都已经被火化了，只有刚刚死去的这个病人尸体还在。知县决定前去看看这具尸体，两个人来到停尸房，结果发现尸体不见了。知县当即展开了调查，偷尸体的人董豹被抓到，并且指认是吴夲指使自己去偷的尸体。吴夲十分震惊，连忙辩解。但是知县糊涂异常，根本不相信吴夲的辩解，把吴夲给压入了大牢。鲍大银来到了牢房看望吴夲，吴夲给了鲍大银一瓶毒药，要求鲍大银想办法给董豹吃下去。知县发现董豹中毒十分着急，但是城中没有更好的大夫，屠远只能够找到了牢中的吴夲给董豹治疗。吴夲表示自己医治的时候不能够有其他人观看，否则会被毒血给溅到。吴夲趁着没人威胁董豹，如果不告诉自己真正的指使者是谁，自己就不给对方解毒。
从董豹的嘴里吴夲终于得到了指使者的真正名字。吴夲假意声称自己没有全部解开毒药，省的知县打算把自己给惩治了。秦大悲终于从山洞里面取出来了冰火元魄，打算把吴夲和无玄公主变成神仙。秦大悲劝告青竹最好还能皈依证道，但是青竹对此不屑一顾。秦大悲询问青竹为什么帮助自己，青竹笑而不语。吴夲来到了厨房里面，正好遇到了在这里吃东西的谢万山。吴夲故意告诉谢万山，自己下毒是下给了董豹，并且说自己这样子是为了陷害那个主使者，这样董豹就会以为是主使者给自己下毒，自己再出面救治董豹，董豹就会告诉自己主使者的名字了。吴夲告诉谢万山，自己已经知道这场瘟疫就是谢万山做的手脚，特别是户籍被烧的事情，肯定和这十三个人的身世有关。原来在四十年前，十三太保追杀土匪来到了谢万山所在的村子里，但是没想到为了谎报军功，这十三个人屠杀了村子所有人，只有躲在草堆里的谢万山逃过一劫。谢万山由此发誓，自己一定为所有的乡亲报仇雪恨，过了四十年他才等到了这个机会。听到这里，吴夲感慨万千。谢万山表示自己虽然是为了报仇，但是毕竟杀死了人，自己愿意认罪，但是董豹只是帮助自己搬运尸体而已，并没有罪过。随后谢万山自己服下了毒药，打算自杀。青竹用取出来的冰火元魄复活了瘟君，瘟君得意洋洋。吴夲找到了屠远，告诉屠远有两条道路，要么说出实情真相，屠远被降职，要么将计就计，表示这就是瘟疫，但是已经得到了治疗。思考再三，屠远决定隐瞒真相，上报朝廷，表示谢万山是因为抢救瘟疫，死在前线上。瘟君把秦大悲关在了筛子里面，并且前去燕城找到了无玄公主和吴夲。瘟君打算把无玄公主变成神仙，前去找太上老君询问方法。
盖仲景接到了燕城送来的信件，得知瘟疫解除。楚练非常开心，但是盖仲景虽然故作高兴，实际上却神色阴沉。鲍大银劝告吴夲留下来，说不定还能够封个官当当，但是吴夲却无意做官，只希望能够帮助百姓治疗。吴夲把自己所有的银子给了鲍大银，鲍大银已经预感到对方打算离开自己，十分伤感。鲍大银依依不舍的目送吴夲离开。李公子来到了大方医馆，表示自己要接手医馆，屠远十分惊讶。盖仲景拦住了吴夲的马车，但是吴夲却无意留下来。太上老君的侍女送来了王母的仙桃，太上老君吃过仙桃以后当即昏睡了过去，原来这个侍女竟然是青竹假扮的。吴夲的马车半路上忽然被一队士兵阻拦住，吴夲被诬陷是辽国的间谍，随后被捉拿了起来。原来这是盖仲景的阴谋，盖仲景打算从吴夲那里得到治疗瘟疫的秘籍，楚练更是打算对吴夲用刑，但是盖仲景却认为如果强行逼迫，吴夲反而不会交出来医术秘籍，盖仲景打算利用楚练来演一出戏。鲍大银无意中得到了关押着秦大悲的骰子，这个骰子能够按照秦大悲的意愿转变点数，秦大悲连忙劝告鲍大银把自己的骰子给拿起来。楚练来到牢中，故意说自己认错了人，吴夲并不是间谍，随后放走了吴夲。青竹从太上老君那里频频套话，但是太上老君却一早识破了对方其实是妖魔的身份，根本不可能说出来如何把无玄公主变成神仙的方法。鲍大银拿到了万能骰子，当即打算大展身手，好好的在赌场里面赚一大笔银子。盖仲景自信满满，认为吴夲在京城人生地不熟，一定回来投奔自己，但是吴夲却迟迟没有出现。
盖仲景正在和楚练商量着吴夲必定会来到自己府中的。就在此时手下来报，府中有人拜访，果然是吴夲前来求见。吴夲请求盖仲景帮助自己一个忙，自己打算去看望一名囚犯，希望盖仲景能够帮忙。鲍大银在赌坊里面赌博，但是却因为太上老君的使坏，鲍大银忽然就输了，心中十分郁闷。太上老君和青竹打赌，太上老君如果输了就要给青竹怎么把人变成神仙的方法，而青竹如果输了，就要给太上老君身边的青牛当老婆。盖仲景表示自己一定会帮忙让吴夲和辽国女间谍见上一面。青竹和太上老君打赌，青竹表示要太上老君完成大冒险的游戏，和一个长得很丑的女子接吻，这个女子是瘟君变化的，太上老君不敢，于是输了这个游戏。鲍大银抱怨秦大悲竟然让自己输了，秦大悲表示这都是太上老君的过错，鲍大银愤怒之下打算找太上老君算账。青竹终于从太上老君那里拿到了人神相变的秘籍，瘟君大喜过望。吴夲终于成功的来到天牢里面，见到了辽国女间谍。但是这个间谍其实就是楚练假扮的，吴夲表示自己有办法救出对方，给了楚练一种假死的药物。鲍大银来到太上老君庙找太上老君的神像为赌债算账，信徒看不过眼于是找来了衙役，鲍大银匆忙逃走。吴夲和盖仲景从天牢里面接走了楚练的“尸体”，随后把楚练带到了郊外，成功的从天牢里面逃了出来。瘟君找到了鲍大银，打算把对方变回无玄公主，但是按照太上老君的法术施用，最终却没有管用，青竹还毁容了。秦大悲在骰子里面热的死去活来，从炼丹炉里面逃了出来。秦大悲找到了太上老君，太上老君把真正的秘籍教给了秦大悲，秦大悲下界找到了吴夲，吴夲暂时性的恢复了记忆。
太上老君教给秦大悲的秘籍并不完整，吴夲只能恢复了一部分的神仙功力。秦大悲要吴夲赶紧回复记忆，想起来完整的秘籍。吴夲找到了鲍大银，没想到无玄公主变成了现在这个样子，而且完全不是以前那种气质高雅的公主风范。随后鲍大银还拉着吴夲，要吴夲带着自己回到吴夲的老家，吴夲一时之间手忙脚乱。瘟君开始想办法给青竹恢复容貌，但是却不起作用。吴夲无奈之下被鲍大银拉着回自己的老家同安，半路上遇到了劫匪。鲍大银把自己手里当当作响的包裹给了劫匪，拉起来吴夲就开始逃。吴夲询问对方为什么把银子给劫匪，结果知道里面原来是鲍大银煮过头了的茶叶蛋。吴夲的记忆只有很短暂的恢复，秦大悲再次来到天庭找太上老君。吴夲来到了老家，开始给乡亲们义务看诊，非常受欢迎。鲍大银和吴夲来到了杂耍班看变戏法，没想到此时盖仲景也在戏台旁边。戏台上的戏子忽然间倒地，其他人大喊着这个人死了，纷纷逃开。捕快秦越这个时候也在现场，上台检查了尸体，手法非常娴熟，吴夲大为赞赏。盖仲景上台检查过了尸体以后，表示自己有办法揪出来凶手。秦越分别给戏班里的所有人把脉，并且一把抓住了楚练假扮的厨娘的手，告诉大家楚练的手指甲缝里有死者脸上的油彩，因此楚练就是凶手。吴夲看不下去，于是上台表示并不是所有的紫色都是油彩，最终发现楚练手指甲里的不过是茄子皮而已。但是随后秦越发现楚练衣服上的绣花少了一朵，验证以后发现这一朵花竟然在死者的手中。楚练当即被指认为凶手，被秦越带回了大牢。
鲍大银和吴夲来到了吴夲的家中，鲍大银坚决要求嫁给吴夲，吴夲十分奈何。而鲍大银则自顾自的在房间中准备大红喜字和其他的东西，吴夲尴尬异常。此时吴夲在担心着牢房中的楚练，因为秦越实在是个逼供的高手，吴夲担心楚练因为扛不住刑罚屈打成招。秦大悲再次找到了吴夲，暂时性的恢复了对方的记忆。吴夲告诉秦大悲自己有办法拖延瘟君一段时间，并且告诉了秦大悲一个方法。吴夲来到了衙门前面，结果从捕快老崔的口中得知就在一夜之间，戏班的所有人都横死，随后秦越出现，表示吴夲就是犯下了杀人案的杀人凶手，吴夲忍不住苦笑了起来。秦越怀疑楚练和吴夲是一伙的，两个人合伙杀死了所有的戏班人员。吴夲主动提出前往义庄验尸，秦越同意了。鲍大银半夜里找到了吴夲，吴夲吓了一大跳。吴夲验过了尸体以后发现少了第一天横死在戏台上的那个人。得知此人已经被下葬以后，吴夲来到了坟地里面，和老崔一起挖开了棺材，结果发现竟然是楚练在里面。吴夲救出来了楚练，鲍大银被吓得昏迷了过去。吴夲把鲍大银和楚练一起带回了家中抢救，第二天发现老崔的尸体在自己家的竹林里面。楚练醒来了以后告诉吴夲，是秦越下令把自己给钉进的棺材。得知不妙以后，吴夲当即和楚练鲍大银一起逃亡。秦越来到了吴夲的家中，结果只扑了个空。秦越前去面见自己的上司，打算通缉追杀这两个人，但是盖仲景告诉秦越，必须得活着抓住这两个人，让对方俯首认罪。鲍大银发现自己等人被官府通缉，出言埋怨楚练拖累了自己。吴夲三人来到了八方客栈的后厨里面躲藏，但是厨子却因为缺钱打算出卖吴夲。
厨子甲劝另一个缺钱的厨子可以去衙门举报吴夲，结果反而被对方给臭骂了一顿。秦大悲找到了太上老君，告诉对方吴夲告诉自己的计划，并且从太上老君那里拿到了丹药。鲍大银十分担心吴夲在客栈里面被抓到，但是吴夲竟然看上去一副胸有成竹的样子。鲍大银和楚练为了掩饰身份，两个人扮成了男装。盖仲景和秦越谈话，表示自己十分欣赏秦越的廉洁，语在催促秦越尽快抓到吴夲。八方客栈的老板娘海莲和吴夲是旧识，海莲也就是捕快老崔的妻子。鲍大银一开始十分吃惊，但是随后知道原来多年以前吴夲曾经拼死给老崔吸毒，所以哪怕吴夲被陷害，海莲也始终不相信吴夲会毒害老崔。秦越和盖仲景来到了八方客栈里面，要老板娘出来说话。盖仲景亲自去查看过了入住客栈的姓名簿，发现了问题。盖仲景随即搜查了客栈，并且抓到了鲍大银。吴夲此时正在后厨里面，听说以后冲出去打算救鲍大银，但是却被厨子给死死地拦住了。鲍大银被带到了海莲和盖仲景的面前，海莲却坚持不肯相信吴夲会害自己的丈夫，并且认为只有保住吴夲，自己才能够找到杀害自己丈夫的凶手。秦大悲变成了一个美女的样子，打算色诱瘟君，瘟君果然上当，没有认出来秦大悲的真实身份。吴夲来到了戏院的后台查看情况，结果和来到这里查案的秦越正好碰上。吴夲分析了案情，发现当初无常鬼中的毒药是一种波斯毒药叫做“沙中语”，这种毒药来自海外，非常难以买到。随后吴夲指出来，楚练正是害死了无常鬼的凶手。吴夲表示只要碰过了这种毒药的人，脸在窒息的情况下会出现一种奇异的嫣红，而自己在从棺材里面救出来楚练的时候，楚练的脸上正有这种红色，表示楚练肯定碰过这种毒药。
吴夲说出了自己指认假扮夏璇的楚练其实就是真凶的事情，夏璇也随后认罪。夏璇表示无常鬼李建罪大恶极，这个人表面上是一个媒人，但是却把这些女子都骗走，卖到妓院里面或者一直折磨。夏璇的妹妹也被折磨到死，夏璇之所以杀死李建就是为了给自己的妹妹报仇，吴夲连忙恳请秦越能够放过夏璇，夏璇杀死的也是罪大恶极之人。夏璇生气的指责秦越下命令把自己封死在棺材里面，但是秦越却一口否认自己并没有这么做过。夏璇随后逃窜，秦越追了上去，夏璇随后给秦越的眼睛里面撒了毒药。吴夲匆忙追了出来，却发现夏璇被人绑了起来，夏璇说自己并没有给秦越用毒，秦越根本不相信，不顾自己眼睛中毒，坚持要把夏璇送到衙门里面关起来。无奈之下，吴夲只能够陪着夏璇来到了牢房里面。吴夲主动说自己有罪，自己进入了府衙大牢里面陪着夏璇。盖仲景给秦越治疗，盖仲景表示这个毒药自己没有办法解开，也许下毒的人才有办法解开。楚练私下里去见了盖仲景，表示自己还没有拿到秘籍，自己陷害吴夲的事情恐怕也随着秦越对于吴夲的好感度上升变得越来越麻烦。盖仲景要求楚练取得吴夲的信任，趁机拿到秘籍。吴夲被关到监狱里面，没想到竟然正好和鲍大银关在了一起。牢头因为关节疼痛请求吴夲医治，吴夲很爽快的答应了。盖仲景表示秦越的眼睛没救了，还要求上司把秦越给辞退，秦越私底下听到以后十分伤心。秦越碍于面子不肯去求助吴夲，吴夲于是委托牢头把秦越带到了牢房里面。吴夲要求秦越带自己三个人离开，自己帮助对方解毒。三个人成功离开了监狱。秦大悲变的美女勾引瘟君，青竹看着十分嫉妒。
