五年的追逐化为乌有，随着X档案的封锁，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）和丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）自愿调任处置一些往常的案件某天，美国得州达拉斯市发作一同爆炸案虽然穆德和斯科莉竭力疏散写字楼内的人群，但爆炸还是攫取了4名无辜者的性命，他们也因此遭到下级的指摘。但是预先不久，穆德便得知4名牺牲者早在爆炸之前便已死亡，所谓爆炸案不过是某个微妙部门为了掩盖证据而实施的骗局。该部门听说多年来不时从事外星人的研讨，并且他们的研讨足以招致人类的消灭。两名同伴决议彻查此事，但是微妙且难以依从的力气无时无刻不在阻遏他们跟随真相的脚步……本片为同名美剧的第一部剧场版。
