第一季结局时，第十三号仓库发生了爆炸，出入通道完全被毁，Artie被烈焰吞没，应该已经「归天」……但是McClintock证实，扮演Artie的Saul Rubinek第二季将继续演出。他将以什么方式回归，这依然是个谜。 McClintock说，第二季将出现一个新的反派角色。与此同时，前仓库特工、Artie的死敌James MacPherson也将回归。新出现的反派角色将比MacPherson更狡猾，更聪明，他将取代MacPherson在第一季里的地位。McClintock称第二季的剧本质量明显强过第一季。 故事将紧随第一季结局展开。MacPherson将Artie炸成了灰，Artie失踪了。Artie还活着吗（小提示：废话！）？Leena真的是叛徒吗？Claudia去哪了（小提示：Artie来到欧洲粒子物理研究所CERN追踪Claudia的下落）？第十三号仓库能否逃过此劫？在MacPherson离开之前的这段时间里，究竟在仓库里做过什么（小提示：他释放了一名「危险分子」）？除了MacPherson之外，还有更大的幕后黑手吗？在没有Artie的情况下，Pete、Myka将如何应对危机（小提示：他们来到英国追踪被MacPherson释放的「危险分子」）？这些问题都将在第二季首集中得到解答。
底特律发生奇怪的案件，小偷入室偷盗时。被人像飞碟一样抛出房间。谁有这么大的力量，能把一个人抛得远远的？警方一筹莫展，皮特和梅卡介入调查。皮特和梅卡根据线索来到一个咖啡店。并且用药剂清洗了咖啡店里的古物，但是没有任何作用。店主洛特和男服务生杉顿关系暧昧，杉顿处处保护洛特。不久，案件再次发生，皮特意外发现杉顿变成了漫画中的无敌英雄“铁影”，在城市里除奸铲恶。细心的梅卡发现，杉顿每次变身前，手都会颤抖不已，证明他身体的磁场在改变分享者.影视。克罗蒂娅赶到底特律，协助皮特和梅卡战胜“铁影”。阿提经常看到迈克·波顿的幻像，十分害怕。想了很多办法都无法赶走迈克·波顿，阿提自我反醒，发现心里很牵挂老搭档迈克·波顿，阿提寻访了迈克·波顿的家，并且发现了迈克·波顿留给自己的信。而迈克·波顿的幻像，看到阿提真心想念自己，于是安心地离开这个世界。
Claudia试图「升级」她的新Farnsworth对讲机，遭到Artie的臭骂。Pete的东西还没有邮寄过来，而且当地人都很讨厌他。偏偏在这个时候，当地的邮局被关闭了…… Pete和Maya经过一家兽医站，和女兽医互相对望了一眼。女兽医突然看见了一道蓝色的闪光，然后有三个海军陆战队士兵从兽医站前经过。不久后，Artie带着Claudia与Pete、Myka紧急会面。Artie称Univille镇上有一件超自然物品，要三人立即寻找。为方便「入户调查」，他还给他们配发了「制服」－－国税局税收专员的制服。难怪镇上的人都恨他们…… Leena感觉头晕的情况越来越严重，不得不向Fredrick夫人求助。Fredrick夫人带着仓库管理委员会的高级成员Valda先生及一个叫Taka的神秘女人来到B&B旅馆。Taka打算用MacPherson的方法来移除MacPherson对Leena大脑造成的影响：再次对Leena使用「智慧珍珠」。Fredrick夫人认为危险性太大，但Valda坚持要这么做。 Pete和Myka询问了那个叫Kelly的兽医，Kelly将看到海军陆战队士兵的事情告诉他们。她还称这些士兵的胸口有「喷火狼」的标志。Claudia四处寻找修复Farnsworth的零件，在当地一家硬件商店遇到了年轻的雇员Todd。Claudia的Farnsworth突然失去了控制，Claudia跑到外面，竟亲眼目睹了一场「牛仔大决斗」。而几个街区之外，Pete和Myka也遭遇了一次只有在电影中才会有的「西部枪战」。 由于硬件商店突然消耗了大量能量，三人汇聚到这家商店寻找源头。他们的Farnsworth突然「集体失控」，空气中出现一个角斗士和一头老虎。Pete认出这是一部经典电影中的场景，但他也被角斗士的剑狠狠刺中。那些影像是虚幻的，可是Pete的伤是真实的，这让他们感到恐惧。如果不尽快阻止这件怪事，肯定还会有人受伤。Claudia试图从Farnsworth上寻找原因，而此时Kelly的兽医站又出现了新的幻象。Pete想起了这些幻象的共同点：他们都来自演员Raymond St. James演过的电影。此人主演的下一部电影《Dr. Doomsday》可能会炸掉整个Univille。 Artie发现了真实情况：Philo Farnsworth同时发明了三维摄像机和放映机，准备在战场上迷惑对手。第十三号仓库里储存着摄像机，但是放映机不知所踪。Pete、Myka和Claudia最终发现，放映机让那个刚刚下岗的邮政局工作人员拿去了……她认为这只是一部「有点酷」的普通放映机，将它放在家里看Raymond St. James的电影。虽然找到了源头，但Pete等人并不能阻止幻象的发生。他们必须录制一些新的东西，来抵消放映机正在播放的东西。在众人的共同努力下，「Dr. Doomsday」终于被「制服」了。 与此同时，Fredrick夫人也完成了对Leena大脑的「清除」工作。Fredrick夫人显然比Taka要厉害得多。当Leena询问Fredrick夫人自己是否没事了，Fredrick夫人用很不安的口气回答：「是的。」
