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六月的淮北苏皖边区农村。一支披红挂彩、喜气洋洋的迎亲队伍正在行进中，突然，十几辆自行车迎面驶来，骑车人人手一把驳壳枪向迎亲队伍猛烈射击。瞬间，迎亲队伍便倒在血泊之中，无一生还。喜事变丧事，平静的村庄笼罩在一片血腥氛围之中。而臭名昭着的飞车队队长何二刚与手下肖德贵等大汉奸正是这起杀戮事件的元凶。随后，深得日本鬼子赏识的飞车队对我抗日边区进行蚕食、破坏、袭扰、暗害，捕杀我党军政人员和地方干部。种种罪大恶极的行径使得边区百姓终日人心惶惶。为了坚决粉碎敌人对我边区的伪化、蚕食和破坏，在边区公安局龙雨局长的申请下，我党成立了一支淮北军区便衣大队。随即，便衣队成员的选拔比赛开始了，可谓是人才济济，八仙过海各显神通。与此同时，公安局得知日军淮北联队司令藤野在李集镇喜乐来饭庄举行宴会，一个消灭汉奸的好机会到了。共2张敌后便衣队传奇第2集
便衣队初战告捷，但队员们似乎并不兴奋，在他们看来，五大金刚执行这样的任务实在是大材小用，并当面向龙局长表示不屑甚至要求离队。后经龙局长和陈忠华晓之以情动之以理的劝说，加之百姓们亲临公安局登门跪谢，队员们才明白"这样的任务"对百姓意义重大，抵触情绪渐渐消失。何二刚被处死的消息很快传到了藤野那里，藤野开始策划杀害我抗日民众的新计划。为了更好的在敌后作战，队员们必须脱下军装换便衣，并改掉已经习惯了的军人作风，这样的改变对他们也是一大考验。更令人尴尬的是，正当一群赤裸的老爷们在换衣服时，年轻的报务员毛妮子居然闯了进来。陈忠华曾经护送过的前女特工灵芝忽然来到便衣大队，当得知灵芝真名贺兰，将担任便衣大队政委时，陈忠华倍感意外，两人心照不宣地笑笑，弄得在场的龙局长一头雾水。龙局长的警卫员二柱子与伍怀章在回公安局的路上遇到一群汉奸伏击，二柱子纵马挥枪，三下五除二把他们制得服服帖帖，夺路而去。公安局的会议室内，龙局长宣读军区任命，尚未报到的高德良任副大队长，贺兰任政委，全场响起一阵雷鸣般的掌声。男人窝里终于有了个漂亮的女人，俗话说男女搭配干活不累，看来不无道理。但在陈大队和关副队这两个大男人眼里，让一个女流之辈与自己平起平坐似乎不合常理。伍怀章带来了十万火急的重要情报，伪保安旅长吴魁仁准备动用他的直属别动队，在云水镇以军火为诱饵，伏击县武工大队，而武工队却不知有诈，已准备前往云水镇抢夺军火。时间紧迫，加上武工队、别动队各自部署不详，最要命的是武工队此刻身在何处无从知晓，这让便衣队在制定营救计划时面临了诸多困难。但龙局长最终决定铤而走险，率便衣队亲赴云水镇，以搅局为目的开始了这次行动。龙局长与吴魁仁在湘江战役中曾交过锋，对他深恶痛绝，恨得牙痒痒。
队员们分布在茶楼和街道，警惕地观察着每一个微小细节，敌我双方暗中较量了一天依然没有结果，原来吴魁仁用的是"海水退去，沙贝自显"这一招。夜晚的到来使得便衣队员们逐渐暴露，龙局长只得与吴魁仁面对面开始了一场激烈的战斗，但这次行动最后以失败告终。飞车队准备趁抗日农会在盐阜集会时，血洗盐阜村。便衣队获取情报后决定在飞车队行动时对其迎头痛击，同时派二柱子通知我王集区委提前组织农协会转移。一场便衣队与飞车队的较量即将上演。为准备三天后在盐阜村痛击飞车队，陈忠华和关涛、二柱子以及两支地方抗日武装的领导提前到盐阜村化装侦察地形。不料，竟然在此遭遇提前行动的飞车队及新上任的队长肖德贵。陈忠华当机立断，命二柱子回公安局调便衣队驰援，命令两位领导也各自回去搬救兵。他和关涛留守盐阜村尽量拖住飞车队，只等援兵到来将飞车队就地歼灭。陈忠华与关涛默契配合，施计把飞车队牢牢牵制在盐阜村，飞车队摸不着头脑乱了阵脚，见形势不妙纷纷向村外撤离。紧急关头，贺兰率领便衣队及时赶到，一番激战，飞车队被聚歼，遗憾的是肖德贵却趁乱逃跑了。
肖德贵来到藤野面前，藤野狠狠地抽了肖德贵几个大嘴巴。飞车队的溃败使藤野颜面大失，他下令将在云水镇抓获的九名武工大队战士押往野狗坡集体活埋，以雪奇耻大辱。便衣队虽然聚歼了飞车队，但是敌人血洗盐阜村的行动为何提前，龙局长怀疑有人从中泄密，第一个被怀疑的就是提供情报的黄老板。可是经过盘问和考察，黄老板的嫌疑被排除了，那究竟是谁把便衣队准备围歼的情报透露给了飞车队，并导致飞车队提前行动，对泄密者的追查工作围绕着王集区委秘密展开。藤野张贴了活埋武工大队战士的布告，藤野要让百姓知道，跟皇军作对没有好下场，同时也是在向便衣队叫板。一场血腥的杀戮即将在野狗坡进行，藤野在劝降无效的情况下，下令将九位武工队战士推下事先挖好的大坑。看到自己的战友被敌人残忍杀害，二柱子难忍心中之恨，起身向敌人冲去，同时龙局长的枪也响了，可二柱子已被敌人的机枪击中。龙局长一人指挥着群众撤离，陈忠华带领便衣队赶到，打退了藤野和吴槐仁的部队。但九名武工队战士牺牲了，二柱子牺牲了。毛二柱牺牲后，经局党委研究，批准毛二柱的妹妹毛妮子正式加入淮北便衣大队。由于肖德贵在盐埠村吃了败仗，藤野冷落了他，每天游手好闲的他正好为便衣队除掉这个狗汉奸提供了机会。
趁着肖德贵来浴室洗澡的机会，便衣队员里应外合，最终由陈忠华亲手将肖德贵就池正法。浴室内一切进展顺利，但在浴室外担任警戒的贺兰等人却意外的与别动队撞到了一起。贺兰处变不惊，灵活机智、软硬兼施地将别动队制服。正当关涛、陈忠华、贺兰准备突围时，冷不防肖德贵另外两个保镖却把枪口对准他们三人。一番周旋后，贺兰的枪口对准了两个保镖，而之前被惊动的日本鬼子也已经赶到，贺兰果断地将二个保镖打死。副官带领手下边对天放枪壮胆，边驾驶摩托车扑向浴室方向。枪声让伍怀章带领的正在撤退的便衣队员们担忧关涛他们的安危。他们决定由五大金刚前去歼敌，一场花样百出的歼敌战开始了。汪晓阳兴致勃勃的指挥加上焦猴子等的绝招怪招，什么尿浇鬼子头，镖中猪脖子，舞步双枪射，打得日军落荒而逃。日军副官看此状况改变了战略，转攻为守，成功的阻击了便衣队的反攻。正在这时，马洛新开发研制的保龄雷起到了作用，还促使双方进行了一场别开生面的足球赛。
贺兰单独被军区领导召见，与一个代号司机的特工去暗杀汉奸吴槐仁，得知吴槐仁的致命弱点是好色后，贺兰决定巧施美人计，让吴槐仁做个风流鬼。趁着县商贸会会长赵岭贵举行的酒会，贺兰与助手司机二人里应外合，成功地将前来参加酒会的吴槐仁引诱上钩。可是就在二人出了赵公馆准备去睢宁饭店时，吴槐仁的十三姨太意外出现在他们面前，无奈的吴槐仁最终又被带回了酒会。赵公馆的舞会上，吴槐仁被十三姨紧紧看住，刺杀计划陷入僵局。贺兰决定从赵岭贵这里做文章，此人非常希望吴槐仁能与贺兰做一对露水夫妻，但苦于十三姨的看管，一时也无计可施。
贺兰"指导"赵岭贵假传藤野命令，将吴槐仁从十三姨身边成功"解救"出来，刺杀吴槐仁的任务在睢宁饭店的客房内由贺兰执行。三声轻轻的枪响后，大汉奸吴槐仁当场死在贺兰脚下。贺兰与"司机"的首次合作默契又成功。而这个代号司机的特工就是迟迟未来便衣队报到的副大队长--高德良。在贺兰刺杀吴槐仁的同时，同一座县城的火车站里，陈忠华亲手击毙了准备上火车去南京私出的藤野。藤野的行踪是黄老板提供的。刺杀吴槐仁、藤野成功后，军区给陈大队长和贺政委各记了二等功，这让一向清高的高德良内心十分不平衡，产生了不满与抵触情绪。范世璜却察觉来者不善，指使狙击小组在便衣队返回的路上设伏，企图消灭便衣队。大难不死的藤野伤愈后又回到他的淮北联队，为了复仇，他亲手用机枪杀害了我军战俘几十人。军区命令便衣队炸毁三铺镇鬼子的三座炮楼，为牺牲的战友报仇。陈忠华、贺兰、关涛等假扮送粮食的农民混进了日军在三铺镇的兵营，并安排马洛在厨子老魏身边拜师学艺，为炸炮楼做准备。不料藤野突然出现在厨房，陈忠华大为惊讶，与其周旋。
按约定，陈忠华、贺兰等人从鬼子炮楼出来后去茶楼和伍怀章会面，不料却在茶楼碰上吴槐仁别动队的骨干老那，老那曾在云水镇战斗中见过陈忠华他们。情况万分危急，陈忠华巧妙处置并安全撤离，但由此得知一个情况--吴槐仁的十三姨太要为夫报仇，杀掉贺兰，而这座茶楼恰是十三姨的家产。鬼子兵营里的炊事班成员都是伪军，马洛以学艺为名在此待了好几天，搜集了三座炮楼的所有信息。一日，陈忠华按马洛的要求，将三只盛汤用的大瓦罐送进炊事班，但这瓦罐已被改制成三个大炸弹。一切准备就绪，精心制定的炸毁鬼子炮楼的行动开始了。三只大瓦罐被巧妙地送进三座炮楼，定时器准确起爆炸弹，三座巨大的炮楼一炸冲天。便衣队随即冲进兵营，将残余鬼子击毙。毛妮子的小姨在范世璜家干保姆，龙局长决定让毛妮子以保姆身份潜入范世璜家中。
吴槐仁的十三姨太妻承夫业，被藤野任命为别动队队长，直属他领导。为了制止十三姨对贺兰再起杀心，陈忠华派老战友、救命恩人高德良单独前往三铺镇执行一项特殊任务，以徐州大商人的身份接触十三姨的父亲十三爹，让他规劝十三姨摒弃恩怨，停止追杀贺兰。潜入范家的毛妮子开始搜集范世璜与藤野暗中勾结的证据，成果斐然。按约定，十三爹叫来十三姨与高德良在"好再来"酒楼见面。这一见，就此引发了一连串戏剧性事件并贯穿全剧，两个人的命运也就此改变。原来，高德良和十三姨是一对旧时相好，两人因故分别已有十年，这是十三姨苦苦等待高德良回来娶她为妻的十年。当十三姨走进雅间与高德良见面的一瞬间，二人彻底傻掉了。
毛妮子趁范世璜不在，潜入其书房，发现了他与日本人的电台联系。为了不影响贺兰接下来的工作，龙局和关涛等人决定暂时先将她未婚夫牺牲的消息隐瞒下来。但是长时间的通信中断，让贺兰有了疑心，她开始怀疑庄岩是不是牺牲了。十三姨刻意在家中准备了烛光晚宴与高德良再度会面，她对高德良旧情复发，答应他不再追杀贺兰，但前提是高德良得娶她，最起码留在她身边当压寨丈夫。高德良无语。范世璜在家中接到排长和梁子被捕的消息，随即驱车赶往十三姨家，目的是请她的别动队出面干掉狙击手的上司，杀人灭口，保住自己勾结藤野的秘密，不料撞上了正在烛光晚餐的高德良。趁范世璜离家，毛妮子和关涛悄悄走进他神秘的书房。毛妮子和关涛在范世璜的书房里意外地发现了一部电台和一本密码词典及几份电报。
