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美国政府利用卫星监听和定位系统直监视着著名的毒枭毒药，在确定他的交易位置后，将任务交给了缉毒局在哥伦比亚的卧底墨菲。墨菲在哥伦比亚的行动受限，于是打电话报警，将信息透露给自己的搭档搜捕队的潘那。 潘那组织人手突袭了毒药的交易现场，一时间也是血流成河。早在1973年的智利，军方抓捕并处决了三百多名的毒贩，代号蟑螂的毒贩死里逃生，摇身一变成了最大的毒贩。而走私商人埃斯科瓦尔收买了全国大部分的警力，让自己的走私生意开展的顺风顺水，就算偶尔有不愿意配合的警察，埃斯科瓦尔也能和颜悦色的威逼利诱从而使大家顺从他。蟑螂找上了埃斯科瓦尔，想让他帮助销售自己生产的可卡因，埃斯科瓦尔对此很感兴趣，两人一拍即合。蟑螂带着埃斯科瓦尔去自己麋鹿的生产基地参观，而此时蟑螂的制毒基地还是个小小的作坊。埃斯科卡尔利用自己的关系，用汽车将毒品运送出去，仅仅这一趟他就轻轻松松的赚取了五十多万美金的利润。这样，蟑螂和埃斯科卡尔的联系更加的紧密起来。那时的墨菲还在迈阿密执行任务，他因为同事的恶作剧认识自己的妻子，从此陷入情网。回到麦德林后，埃斯科瓦尔建立了自己的实验室，由蟑螂负责制毒，自己和古斯塔沃负责销售出去。古斯塔沃找到了一个叫狮子的人，将毒品带到迈阿密，卖给那里的权贵们。很快埃斯科卡尔富得流油，可卡因源源不断的从秘鲁运到麦德林，单凭狮子一个人已经很难讲他们全部都运送出去。于是狮子收买利用航空公司的飞行员、孕妇、年轻的女孩子将毒品运送出去，再后来埃斯科卡尔在短短的几个月时间内建立了第一条哥伦毕业到美国的毒品运输航线。最后，埃斯科瓦尔关掉了麦德林的实验室，将制毒的作坊搬进了哥伦比亚郁郁葱葱的大森林里，在树林的掩饰之下加大了生产力度。制毒贩毒给埃斯科瓦尔带来了源源不断的财富，增加了蟑螂的不安和不满，也吸引了埃斯科瓦尔商场上的朋友，很快一张巨大的贩毒网络形成了。而墨菲也从追着吸毒的嬉皮士变成了开枪打死贩毒着的缉毒警察。回去之后，墨菲对于自己打死未成年的贩毒者耿耿于怀，但是妻子却说那人本就该死。追问之下，墨菲才知道妻子的医院送来了一个因毒品破碎而惨死的女孩子，尽管妻子尽了全力但还是不能挽救她的生命。埃斯科瓦尔的一批货被早就已经买通的警察合埃拉截住，埃斯科瓦尔一气之下冲到了警局和合埃拉谈判。埃斯科瓦尔被作为嫌疑犯拍下了照片，两人重新订立了协议，合埃拉也将蟑螂供了了出来。原来蟑螂不满埃斯科瓦尔赚的盘满钵满而自己只能窝在从林中，于是私下偷了可卡因，雇了一个哥伦比亚管道公司的人贩卖。不幸的是，管道公司的贩毒车辆载着1200斤毒品被墨菲和同事截获，同事在打斗中不幸身亡，而墨菲成为了英雄。埃斯科瓦尔带人灭了蟑螂的人员，杀死了一千多警察，而这些都是墨菲后来才知道的。古斯塔沃将毒药被被缉毒局的人枪杀的消息告诉了埃斯科瓦尔，问他是否要悬赏捉拿杀害毒药的人，埃斯科瓦尔沉默不语。
墨菲和夫人康妮乘坐飞机到哥伦比亚，从飞机上看下去，哥伦比亚就是一个纯净的森林公园，壮观而美丽。殊不知，在层层叠翠的掩盖之下，罪恶不断的滋生蔓延，可卡因不断的被制造出来，流向世界的其他地方，为毒枭们带来源源不断的美金。雷德专门买下了一座小岛，作为毒品和金钱的流转地，很快小岛就成了毒枭们享乐的乐园。随着毒品越来越泛滥，毒枭们面临着如何将大量的现金转换成合法收入的问题。埃斯科瓦尔开了一家出租车公司进行洗钱，无法洗白的现金被成捆的藏在了各种地方。甚至埃斯科瓦尔开始做起了慈善，将大量的现金直接分发给穷人，一时之间在麦德林穷人中间的呼声极高，埃斯科瓦尔甚至放出了要当总统的豪言。毒枭们的巨额财富引起了当地的共产主义组织M-19的注意，他们决定绑架奥乔亚兄弟的妹妹玛尔塔，以此来谋取大量的赎金。那一天是狮子完成了自己往返美国的第一百趟行程，也是墨菲夫妇到哥伦比亚的第一天。墨菲夫妇一到哥伦比亚就在机场以携带宠物猫的文件不充分被请到了办公室了。但墨菲万万没有想到的是，自己在刚刚踏上哥伦比亚的土地上时就已经被毒枭盯上，而自己连个毒枭的影子都还没有见着。墨菲在哥伦比亚的搭档潘那擅长从那些被毒枭睡过的妓女们身上获得情报。潘那在妓女中发展了一个叫海伦娜的线人，海伦娜迫切的希望潘那能为她提供去美国的签证。两人在一番云雨后，海伦娜告诉潘那自己和其他的女孩即将出发去麦德林。潘那带着墨菲认识了大使馆的人，有带着墨菲找到大使，要求得到麦德林的情报，说毒枭们齐聚麦德林肯定会有大动作。在得到大使的同意之后，潘那带着墨菲来到麦德林和卡里略上校会和，一同到酒店拍摄下毒枭们的照片以增强印象。果不其然，埃斯科瓦尔利用这次玛尔塔被绑架的契机将所有的毒枭聚在一起，宣布成立绑架者终结联盟，宣布自己是组织的老大，负责组织的日常运转，条件就是保证毒枭们不受M-19的困扰。会后，毒枭们寻欢作乐。海伦娜主动勾引了嘎查，状似无意的问起了今天在会上的内容，引起了本性多疑的嘎查的注意。海伦娜被嘎查丢给了下面的小毒枭，可怜的海伦娜遭到了惨无人道的轮奸。潘那迟迟等不到海伦娜的出现，和卡里略上校带人将奄奄一息的海伦娜救了出来。墨菲对于潘那留下他独自行动表示强烈的不满，潘那希望他能明白自己坚持的真正含义是什么。埃斯科瓦尔对M-19的组织进行了大屠杀，M-19迫于压力只好放了玛尔塔。埃斯科瓦尔将M-19被杀人员的照片寄给报社，M-19的头领伊万带着象征哥伦比亚自由的玻利瓦尔之剑前来投降，埃斯科瓦尔并没有杀害他，只是说以后要加强合作。伊万走后，埃斯科瓦尔将组织的日常运转工作交给了古斯塔沃，说自己要去解放哥伦比亚。尽管哥伦比亚罪孽横生，但是有无数的人依然想要通过自己的努力让她变得更加美好，就像卡里略上校，就像康妮夫人。晚上，墨菲夫妇回到家，康妮发现自己的爱猫被悬挂在屋里，墨菲赶紧掏出手枪进屋查看。
康妮的猫被杀引起了墨菲的警觉，经过和潘那的反复推敲，得出结论是墨菲在入境的时候就被毒枭盯上了。墨菲想要就此作罢，只要能够保证康纳的安全就好，但是潘那认为缉毒局的人是不能碰的，这是规则，因为很早以前的齐奇探员牺牲自我才换得了这种认知，现在不能给与那些毒贩们翻盘的机会。虽然只是一只猫的事情，但是那也是缉毒局的猫。于是，潘那带着墨菲找到了哥伦比亚的警察苏亚雷兹，收买了他们查出墨菲的信息是被谁收买的。大量的金钱让埃斯科瓦有些飘飘然，他开始想要正式的进入政治圈。于是，他让自己的情人维莱利娅帮他找来了自由党的律师杜凯，承诺给杜凯每年三十万美金，让他去说服司法部长莱拉让他参选。本来莱拉对于埃斯科瓦尔财富的来源持怀疑态度，但是杜凯拿出一大摞的文件证明埃斯科瓦尔的钱是清清白白的，莱拉默许了。埃斯科瓦尔得到许可后，以安蒂奥基亚省前议员海罗候选人的身份正式开始了自己的选举竞演。他站在穷苦人们和弱者的一边，承诺为他们争取更多的权利，加之有大量的人手和金钱可以兑现他的诺言，一时之间埃斯科瓦尔名声大振，在民众中国呼声极高。他的妻子塔塔顶着大腹便便的孕肚支持他，很快就发现了他和维莱利娅之间的小动作。塔塔求着他不要被维莱利娅拖累，埃斯科瓦尔心疼的安慰着妻子。当晚，塔塔为她产下了一名健康的女儿。苏亚雷兹很快就抓到了机场偷取墨菲信息的两人，一番威逼利诱之下，两人说出了自己的信息是发给了一个叫毒药的人。康纳不顾墨菲的劝阻坚持要去教堂做志愿者，殊不知教堂的教父其实就是共产党人。潘那得知毒药将前往波大，说服美国大使买通卡里略上校在必经之路上设下关卡。不料苏亚雷兹得知后，转手就将消息告诉了埃斯科瓦尔，埃斯科瓦尔立即将毒药叫了回来。这次抓捕活动最终还是失败了，但是也向毒枭们传递了缉毒局对于此事的态度。哥伦比亚的大毒枭们对于埃斯科瓦尔竞选的事情意见不一，古斯塔沃依照承诺退出实验室的管理，大家都认为这是埃斯科瓦尔急于洗白自己的动作。毒枭们一致决定表面上还是支持埃斯科瓦尔的竞选，嘎查和奥乔亚兄弟对此持观望态度。埃斯科瓦尔说自己参加竞选是真的想为穷苦的人民发声，只有雷德相信他的话。竞选即将结束，海罗说自己因为健康和家庭的原因即将隐退，将自由党的接力棒叫到了埃斯科瓦尔的手上，至此，埃斯科瓦尔的一只脚已经跨进了国会的大门。潘那和墨菲告诉大使埃斯科瓦尔就是一个大毒枭，大使要求他们找人指证。两人再次找到了苏亚雷兹，苏亚雷兹将埃斯科瓦尔曾因贩毒入狱的消息告诉了他们，并且将资料管理者的联系方式告诉了他们，但是同样的他转身又将消息卖给了埃斯科瓦尔，一时之间，缉毒局和大毒枭的战争不断，潘那和墨菲终于意识到不能依靠苏亚雷兹，于是抢先找到了当年拍摄的摄影师，并把底片拿到手。大使拿着底片找到司法部长莱拉，希望由他出面指证埃斯科瓦尔。就在埃斯科瓦尔首次踏入国会的一场，莱拉当众展示了他被捕入狱的照片，公然要求他从国会辞职。埃斯科瓦尔的总统梦破灭了，但是他并没有就此一蹶不振，而是针对莱拉展开了报复和反击，在莱拉赴任捷克大使的途中将其杀害，同时，他还召开记者招待会，宣称自己是被污蔑的，原因就是他为穷人和弱者发声。
墨菲对于莱拉的死很是愧疚，谋杀莱拉的杀手被捕后招供了，供出了埃斯科瓦尔是这件谋杀案的指使人。之后，哥伦比亚政府开始全面通缉埃斯科瓦尔，同意了美国政府提出的将毒枭印度到美国接受制裁的引渡协议，这让毒枭们开始紧张起来。墨菲和潘那希望说服卡里略帮助他们抓住埃斯科瓦尔，但是卡里略却对引渡协议并不感冒，而且说上司不会同意自己去抓捕埃斯科瓦尔，埃斯科瓦尔的资源和情报系统更加突出，总是能在警方找到他之前逃走，最关键的是埃斯科瓦尔肯定不会甘心屈服，一定会让哥伦比亚流血的。毒枭们对于哥伦比亚和美国政府达成的引渡协议非常不满，想尽方法与之对抗。嘎查雇佣了以色列的雇佣军人，乔里奥兄弟找公关公司设计了反引渡协议的图标，雷德每天在广播里大肆宣扬美国干预哥伦比亚的政局。埃斯科瓦尔更是直接写信给总统竞选人，抗议引渡协议是美国对哥伦比亚不公平的干涉。美国大使想要借此获得候选人迦兰对于引渡协议的支持，迦兰虽然内心愿意，但还是说自己会从哥伦比亚的最大利益考虑。潘那带着大使拨付的十万美金找到了哥伦比亚缉毒组哈拉米奥将军，说服他让卡里略来负责抓捕埃斯科瓦尔。但不久之后，哈拉米奥却传信来说潘那的贿赂搞反了，自己想要的是解雇卡里略，那样潘那和墨菲就会失去自己最能相信的一个警察。墨菲隐隐约约的觉得，因为埃斯科瓦尔的狂妄自大，他应该一直在等着缉毒局的人去找他。埃斯科瓦尔名下拥有了八百多套房地产，要抓住他并不是意见容易的事情。终于，警方得知埃斯科瓦尔在一座叫蛋糕的庄园里，马上触动大部队前去，但是埃斯科瓦尔还是提前得知了消息，带着家人离去，警察抓到的只是庄园的佣人和园丁。墨菲要的就是这样的结果，他希望埃斯科瓦尔知道就算自己拥有再多的房产，余生也只能在四处逃窜中度日了。值得欣慰的是，墨菲在埃斯科瓦尔没能完全销毁的资料中找到了一个位于麦德林市中心的地址，在那里他们抓到了埃斯科瓦尔的头号会计。埃斯科瓦尔的犯罪证据堆满了哥伦比亚最高法院的档案室，但哈拉米奥却不让潘那和墨菲复印证据。墨菲在资料中发现了一名美国飞行员替埃斯科瓦尔运毒，潘那让墨菲将证据塞进裤子里带走。潘那和墨菲找到了苏亚雷兹，苏亚雷兹告诉他们飞行员原本是中情局的人。墨菲和潘那找到了中情局的远飞行员巴里，在威逼利诱之下巴里将埃斯科瓦尔在尼加拉瓜装载毒品的照片。当时的尼加拉瓜手共产党的领导，美国里根政府对此十分反感，说出了对付毒枭和对付共产党一样重要的话。巴里还是悲哀的命丧埃斯科瓦尔的枪下，但是缉毒组却得到了源源不断的武器、财力、人力的支持，很快的摧毁了加之几十亿的可卡因，并在麦德林最大的制毒基地抓获了雷德。这一切在埃斯科瓦尔的眼里，觉得是美国政府的宣战。埃斯科瓦尔找到M-19的伊万，用二百五十万美金的贿赂，说伊万攻打哥伦比亚最高法院，烧毁了所有的证据。M-19的艾丽莎将消息告诉了康妮，康妮将她交给潘那，自己打电话告诉了墨菲，但是为时已晚。潘那说艾丽莎可以指控此次惨案的背后主使就是埃斯科瓦尔，但是绝对不能将她交给军方。经此一战M-19损失惨重，埃斯科瓦尔如约带来了二百五十万美金，并把玻利瓦尔之剑也交给了他，伊万本来还感动万分。埃斯科瓦尔的人趁着他们不注意，迅速将他们杀死，带走了美金和玻利瓦尔之剑。
潘那背着墨菲和艾丽莎发生了关系，想要将艾丽莎送出去，但艾丽莎称自己坚决不会离开自己的祖国，对于这个烫手的山芋，墨菲和潘那都觉得压力非凡。哥伦比亚军方分析要想揭发最高法院的大屠杀是埃斯科瓦尔指使伊万做的，那所有的证据都集中在艾丽莎和神父的身上。中情局的人说潘那有一名可以作证的证人，但是现在还没有带来。潘那和墨菲赶紧将话题转移，说他们窃听到巴拿马的来电，发现共产党的左翼势力诺列加为毒枭们提供了庇护。长时间的流亡让埃斯科瓦尔开始思念家乡了，也让毒枭们开始对埃斯科瓦产生了对立的情绪，认为是埃斯科瓦尔的原因才使得他们四处流浪。埃斯科瓦尔不得已向哥伦比亚国债局贿赂，希望可以得到特赦，但惨遭拒绝。妻子塔塔得知不能回去之后心情十分抑郁，埃斯科瓦尔说要是现在会去的话就意味着自己需要去战斗，塔塔支持他去战斗。于是埃斯科瓦尔派人暗杀了热门的总统候选人迦兰，以此宣战要回到自己的家乡去。迦兰被杀激起了民愤，大家纷纷悼念这位国家的英雄。在迦兰的葬礼上，迦兰的儿子将父亲的遗志交到了加维利亚的手中。一时间，加维利亚的电话被打爆了，他本人也陷入了深深的焦虑之中。毒枭们从巴拿马回来了，埃斯科瓦尔找来杜凯和维莱利娅，希望他们去说服加维利亚。杜凯和维莱利娅一唱一和的想要说服加维利亚，加维利亚得知了他们的真实意图，无情的将他们赶走。临走时，他们留下了埃斯科瓦尔写给加维利亚的信。潘那去找卡里略，卡里略说自己亲耳听到手下和埃斯科瓦尔交换秘密却毫无办法，因为埃斯科瓦尔可以轻易的就控制住他们的家人，而自己对此无能为力。哥伦比亚军方一直以为M-19的神父是潘那在保护，将军找到潘那说毒贩只是要人钱财，而共产党想要的却是人的全部，要是他发现潘那在保护神父，一定会控告潘那叛国罪的。潘那感到的了事态的严重，加紧为艾丽莎办理出国的手续。埃斯科瓦尔在给加维利亚的心中说，只要保证他们不再追捕毒枭，他们就绝对不会再生事端，否则的话他绝对不会饶了他们。卡里略沉迷于对埃斯科瓦尔的抓捕之中，他已经可以分辨出埃斯科瓦尔的声音，习惯，甚至能听懂埃斯科瓦尔的言外之意。但是卡里略却信不过自己手下的人，因此，他申请建立一支可以不被收买的队伍，于是搜捕队成立了。就在搜捕队紧张的训练时，毒枭们也没有闲着，他们一边大肆的购进枪支弹药，一边在各个地方招募未成年的孩子充当杀手。加维利亚的朋友罗德里戈也被埃斯科瓦尔收买，前来说服他接受六百万美金的贿赂，但加维利亚不为所动。潘那的线人维纳根特为他带来了嘎查会去卡塔赫纳的消息，潘那汇报给大使，大使让潘那去卡塔赫纳监视嘎查，墨菲被留在了原地。临走时，潘那拜托墨菲将艾丽莎送到安全的地方去，他们不知道的是中情局的人已经抓到了神父，从他的口中知道了艾丽莎和墨菲的妻子在一起。加维利亚难得和妻子过二人世界，不想还是被埃斯科瓦尔派来的杀人破坏。晚上，加维利亚看着埃斯科瓦尔的来信，接到了电话说卡里略差点就被刺杀。加维利亚陷入了恐惧之中，但又在妻子安娜的身上看到了勇气和鼓励。在记者招待会上，加维利亚宣布了支持引渡协议，正式向毒枭宣战。加维利亚的态度让毒枭们也加紧了对抗的准备。一个雨夜，卡里略打电话给埃斯科瓦尔，说虽然埃斯科瓦尔知道自己的家人在哪里，但是他也知道他的家人在哪里，这个世界总有不会被收买的人，总有一天自己会亲自找到他。
毒贩们展开了反扑，开始大肆了枪杀警察和士兵。墨菲按照潘那的吩咐准备送走艾丽莎，却在自己的车里发现了窃听器。墨菲只好假装和康妮吵架，自己骗过中情局的围追堵截，让康妮带着艾丽莎离开了，好在康妮顺利的将艾丽莎带走了。送走康妮和艾丽莎，墨菲来到了加维利亚的办公室，加维利亚公开支持了引渡协议，再经过上次的事故，加维利亚的安保工作已经做得相当的细致，但墨菲还是友好的提醒他要注重安全。现在全部哥伦比亚的人民在看着加维利亚，同样的所有的毒枭也在关注着他的行踪。潘那和卡里略带着搜捕队来到卡塔赫纳准备抓捕嘎查，卡里略对于纳维根特的真实意图感到不信任，毕竟警方嘎查能够给纳维根特的钱更多。潘那认为嘎查并不怕死，怕的是坐牢，卡里略说嘎查的武器装备和人员是自己的数倍，一旦失败就意味着会平添很多的寡妇和孤儿，所以他希望嘎查最好是死。虽然卡里略对于结果并不安心，但是他选择了相信潘那。与此同时，墨菲发现了毒药的行踪，在机场和一个西班牙人密切的接触。墨菲拿着西班牙人的照片去找苏克雷兹，在墨菲的淫威下，苏克雷兹将自己知道的都告诉了他，让他去找中情局的人。中情局原本不想理会墨菲的请求，奈何墨菲告诉他们这个人是多起恐怖袭击的炸弹专家。墨菲如愿的在中情局的绝密文件室里看到了西班牙人的资料，他突然意识到这时埃斯科瓦尔针对加维利亚的谋杀计划。嘎查对于这种风平浪静的日子感到十分的不安，他开始变得多疑起来，怀疑纳维根特已经背叛了自己。嘎查敏锐的捕捉到搜捕队来到了镇上，带着儿子和手下逃走。当卡里略带人赶到时，看到的只是被杀死的女佣带着嘎查的帽子瘫坐在椅子上。所幸的是，他们抓到了祎哥号称自己是政府议员的人，在潘那的威胁之下，那人将事情全盘托出。埃斯科瓦尔收买了贫民窟的杰米，杰米憧憬着埃斯科瓦尔承诺的美好未来，对于他的要求全盘接受，还对着埃斯科瓦尔千恩万谢，完全不知道自己即将面临怎样的结局。苏克雷兹打电话告诉墨菲埃斯科瓦尔准备在加维利亚去卡利的飞机上杀了他，还没有来得及说完整个计划，毒药进来将他残忍的杀死。卡里略带着搜捕队到托鲁去杀嘎查，此次是的潘那还是想要活捉。在一番激烈的枪战后，卡里略被嘎查的武器重伤，嘎查趁机带着儿子逃跑。卡里略及时的将消息告诉了潘那，潘那指挥着直升机对嘎查的车辆围追堵截，最终将嘎查和他的儿子杀死。毒药将杰米和带着炸弹的箱子送上了去卡利的飞机，却不想墨菲说服了即将上飞机的加维利亚，取消了卡利的行程。飞机上，无知的杰米打开了箱子，按下了录音键，瞬间所有人的眼前一片白光。
埃斯科瓦尔针对加维利亚的爆炸案病没有伤害到加维利亚，相反一百多名的无辜平民成为了受害者。此次的爆炸案引起了国际社会的广泛关注，哥伦比亚国内支持加维利亚的气势空前的高涨，最后加维利亚成功的竞选上了总统。在总统的就职晚会上，前总统说总统要比别人承认更多的压力已经做更多艰难的决定，建议加维利亚要终于自己的内心和决定。前总统的女儿图尔拜向要知道他们对于美国人的态度，前总统只是说让加维利亚小心。墨菲拍着潘那和卡里略一起找到杰米的女朋友，但是她完全否认了埃斯科瓦尔来过这里，也否认了杰米和埃斯科瓦尔有任何的联系。大家都知道她在撒谎，但现在她是唯一一个能将埃斯科瓦尔和爆炸案联系在一起的证人，他们也拿她无可奈何。但是她不知道的是，国内的局势已经容不得埃斯科瓦尔继续待下去了，和家人依依惜别之后，埃斯科瓦尔吩咐手下的人将杰米的女朋友和所有能将自己和爆炸案联系起来的人都杀死。听到这句话，后排的毒药眼神稍微有些闪烁。加维利亚兑现了抓捕埃斯科瓦尔的承诺，但是拒绝了美国的帮助，卡里略的搜捕队很快就上手开始干了，缉毒队却因为官僚主义只好袖手旁观。发动战争让埃斯科瓦尔并没有占到便宜，相反他只好和卡利贩毒集团的巴丘合作，联合两大贩毒集团来对付美国的引渡协议，不得不眼睁睁的看着自己的市场被占领。缉毒队也没有闲着，他们搞定，了埃斯科瓦尔最信赖的毒药和射手，还得知两名新人加莱亚诺和蒙卡达接手了雷德的摊子。虽然美国不能光明正大的使用监视和窃听，但是墨菲和潘那还是从卫星传回来的航拍图发现了埃斯科瓦尔的势力范围，只要追踪那些豪车就可以找到埃斯科瓦尔。埃斯科瓦尔拍杜凯前来找加维利亚谈判，说要是双方开启谈判的话，可以组织炸弹袭击和为搜捕队争取时间，加维利亚拒绝了。得知结果后的埃斯科瓦尔决定铤而走险，和古斯塔沃一起商议绑架政府高官的家人，烧毁他们的家园，破坏整个社会的安宁，这样哥伦比亚政府就不得不接受他们的条件。古斯塔沃并不赞成他的意见，但是埃斯科瓦尔坚持要一意孤行。很快，很多政府官员的家人遭到了绑架杀害，杜凯再次前来谈判，加维利亚坚持要埃斯科瓦尔释放人质并自首。埃斯科瓦尔更加残忍的杀害人质，甚至绑架了前总体的女儿知名的电视主播图尔拜，希望以此给加维利亚施压，趁机搞垮他。他想的没错，失去孩子的家长几句一堂希望加维利亚可以接受埃斯科瓦尔的条件，但加维利亚顶住压力坚决不同意。埃斯科瓦尔想通过图尔拜替自己向外界宣传自己的人道主义，图尔拜要求释放一名人质，埃斯科瓦尔照办，图尔拜也遵守约定向加维利亚传达了埃斯科瓦尔想要谈判的诚意。图尔拜的录像被寄到了总统府，前总统威胁加维利亚要是不接受埃斯科瓦尔的谈判要求，自己将不会在经济和政治上为他提供任何的帮助。无奈之下，加维利亚一面接受了谈判的决议，一方面让爱德华通知美国人追捕埃斯科瓦尔。潘那和墨菲收到了毒药去公社的消息，当他们赶到时，杰米的女朋友已经命丧枪下，毒药和神射手正在为了是否要杀了他们的小女儿而其争执。眼见着两人就要被抓住，从旁边跳出来一个拿着枪对准他们的小孩。毒药和神射手逃走了，墨菲只好将小婴儿抱回了家。
埃斯科瓦尔要在丛林中建造一座监狱，一直紧绷的神经让他开始变得多疑起来。卡里略在山里发现了埃斯科瓦尔的踪迹，墨菲和潘那也监听到埃斯科瓦尔安排逃走的路线，可是当卡里略带人赶到时，发现埃斯科瓦尔的卫星电话安安静静的挂在一头羊的身上。埃斯科瓦尔再次找到图尔拜，说服她录制视频寄给加维利亚，要求继续透明地进行谈判，要是总统坚持在美国人的帮助下抓捕他的话，他将杀光所有的人质。图尔拜的父母迫切的希望加维利亚可以接受埃斯科瓦尔的建议，将自己的女儿解救出来。但加维利亚坚持不愿意同意埃斯科瓦尔提出的自己建造监狱，让自己的人看守监狱，认为埃斯科瓦尔的意图在推翻引渡协议，着无异于和魔鬼做交易。卡里略的搜捕队找到了关押人质的地方，图尔拜被看守的人将她藏在衣柜里，却还是命丧激烈的枪战之下。图尔拜的死激怒了她的父母，他们当面指责是唯嘉丽娅杀死了他们的女儿。加维利亚面对指责陷入了深深的自责之中，决定同意埃斯科瓦尔提出的谈判。爱德华建议让美国人参与进来，遭到了加维利亚的强烈反对。对于埃斯科瓦尔的有条件投降，就连美国大使都认为是一种生理，但是爱德华激动不已，说这不是异常比赛，自己的人民只想要和平。政府的妥协让埃斯科瓦尔很兴奋，维莱利娅考虑到他承认了毒贩的身份，那就意味着自己新闻记者的身份绝对不能被他连累，所以想要和他提出分手，但是埃斯科瓦尔说维莱利娅本质和自己一样，坚决不同意分手。而另一方，潘那一直说服维莱利娅去美国暂避风头，说要是埃斯科瓦尔的事情曝光，她的名声将不复存在。政府对于埃斯科瓦尔的妥协让卡里略很有挫败感，但是他坚信一定会有和自己一样不愿妥协的警察。埃斯科瓦尔开始安排自己入狱后的生活和生意，让两个接手自己生意的人负担自己和古斯塔沃每个月的开销。然而，就是这种即将得到胜利的时候，晚上埃斯科瓦尔的家被炮弹袭击了，这让他明白，针对自己的不光有警察，还有的是自己人，因为警察不会对自己的家人下手，更不会轻易的动用炮弹。真相就是奥乔亚兄弟和卡利集团的巴丘勾结，和哈拉米奥将军达成共识，只是受了极轻的处罚，代价就是利用自己的妹妹将古斯塔沃献给警察。古斯塔沃在和奥乔亚兄弟的妹妹约会时，被卡里略的人带走。卡里略逼迫古斯塔沃供出埃斯科瓦尔的罪行，但古斯塔沃抵死不从。卡里略杀死了古斯塔沃，伪装成是他先向警察开枪造成的。古斯塔沃的死讯让埃斯科瓦尔悲痛不已，维莱利娅前来告诉他是奥乔亚兄弟勾结卡利的巴丘，埃斯科瓦尔一怒之下命人将正在打球的巴丘杀死。不幸的是，所有的球员都穿一样的一副，等他们发现巴丘是，巴丘已经顺利的逃走了。埃斯科瓦尔接受了政府送来的投降的文件，潘那和墨菲感到不可思议专门跑来观看。埃斯科瓦尔并不是向正义屈服，而是采取了一种权宜之计。墨菲在心里告诉自己，要是再有可以重创埃斯科瓦尔的机会，就算不合规矩，自己也一定要去做。
埃斯科瓦尔的监狱叫大教堂，外表看似破旧不堪，但是内部却相当豪华。源源不断的物资和美女被运送了进来，供那些和他一起坐牢的杀手们玩乐。埃斯科瓦尔将监狱建成一座城堡，可惜还是无法获得自由。埃斯科瓦尔始终不能放下古斯塔沃的死，虽然也知道现在应该和卡利集团和谈，但还是忍不住杀死了巴丘的人。墨菲和康妮收养了杰米的女儿，康妮看见墨菲在和人争吵后掏出枪 对着对方的轮胎开枪感到一阵后怕。加维利亚和夫人看着公园里人来人往一切都恢复了平静，对于自己昧着良心做下的决定稍稍感到一丝的安慰。加莱亚诺和蒙卡达找到巴丘，说明埃斯科瓦尔想要和谈的意愿，但是巴丘认为这并不是埃斯科瓦尔的作风。蒙卡达希望能够解决两派在洛杉矶的争端，出价一千二百万美金，但巴丘只愿意出价三百万。巴丘坚持认为麦德林集团已经穷途末路，但是蒙达卡提醒他现在麦德林的出口量依然是卡利的两倍。巴丘想要借由战争挑拨他们和埃斯科瓦尔的关系，但是两人还是不为所动 。蒙达卡和加莱亚诺将和谈的结果告诉埃斯科瓦尔，说巴丘对于他体现出了相当的尊重和敬佩，但是埃斯科瓦尔很快就戳穿了他们的谎言。搜捕队被解散了，卡里略被派遣到西班牙。墨菲和潘那为卡里略送行，卡里略将哥伦比亚军方低空拍摄的监狱照片拿给二人看，告诉他们现在埃斯科瓦尔的贩毒量更大了，关键的是政府对于他们睁一只眼闭一只眼，他们只需要安心的对付卡利集团就可以了。墨菲和潘那发现埃斯科瓦尔用最原始的信鸽传递消息，很快就将消息截获，以为他在监狱里挖了一条地道，来运送东西。中情局利用红外摄像机没有发现地道所在，大家都以为只是子虚乌有，很快康妮就发现了那辆运送毒枭的货车。潘那和墨菲截住派萨，在他的车里安装了隐蔽的摄像头，威逼他拍下每次运送的东西。当缉毒局的照片被送到了加维利亚的眼前，加维利亚担心的居然是缉毒局会不会把这些照片泄露给媒体。爱德华想要说服加维利亚赶紧采取补救措施，但是加维利亚觉得埃斯科瓦尔现在只能控制这座监狱，如果让他在送进去的妓女和炸弹之间选择，自己会很感激妓女的。家人来到监狱给埃斯科瓦尔过生日，席间蒙达卡的妻子一直抱怨着现在的生意有多难做。虽然她嘴上说着大家都很感激埃斯科瓦尔的牺牲，说这些都是埃斯科瓦尔应该得到的，但埃斯科瓦尔开始有了一丝怀疑，只是面上没有显露出来。埃斯科瓦尔以前藏在地底下的钱被挖了出来，农民害怕自己被牵连进去，转手将钱送给了埃斯科瓦尔的杀手副官。手下有人告诉埃斯科瓦尔蒙达卡和加莱亚诺丢掉的货刚好就只这么多钱，埃斯科瓦尔起了疑心。三人很快就闹得不欢而散，临走之时埃斯科瓦尔还是对两人痛下杀心，然后将两人的尸体肢解烧毁。维纳根特将蒙卡达和加莱亚诺的死讯告诉了巴丘，巴丘让他和缉毒局联系。维纳根特将消息告诉了潘那和墨菲，但是要求交换情报，墨菲坚决不同意。回去之后墨菲和潘那果然没有在照片中发现两人回来的身影，心中对维纳根特的消息相信了。墨菲和潘那决定用自己的办法完成任务。
埃斯科瓦尔在监狱里涉嫌谋杀蒙卡达和加莱亚诺的消息被媒体报道出来，潘那和墨菲受到了同事的赞扬，非常不幸的是，大使不用想都知道这是两人所为，在形势更加明朗之前将他们停职。加维利亚看到报道后头疼不已，爱德华安慰他这是政府结束埃斯科瓦尔假期的最好的机会。高墙之内的埃斯科瓦尔还不知道已经发生的事情，只是询问下属有没有将尸体处理干净，下属拿着报纸都不敢拿给他。哥伦比亚政府经过商议，派出了军队前去大教堂，指挥着是阿里萨将军，一名麦德林人。塔塔看到军队朝着大教堂开区，赶紧通知了埃斯科瓦尔。埃斯科瓦尔接到电话时军队已经出现，他安慰塔塔自己会没事的，然后让手下的人准备好武器。军队将大教堂四周围得水泄不通，胡安要去监狱帮埃斯科瓦尔，被塔塔狠狠的教训，她们都不愿意相信 埃斯科瓦尔会有事。埃斯科瓦尔和下属商量着应对之策，他还是希望能通过和加维利亚谈判将事情和平的解决。埃斯科瓦尔派遣爱德华前来假意和埃斯科瓦尔谈判，说服他转移到由军方控制的波哥大监狱。墨菲被人在车库前劫走，康妮只好找来潘那帮忙。潘那自己没有找到墨菲，只好向中情局求助 ，但还是没有消息。中情局建议立即上报，但潘那坚持再拖延几个小时，因为他还不知到底是卡利集团还是埃斯科瓦尔劫走了墨菲，害怕贸然上报会让墨菲面临和图尔拜一样的结局。爱德华不惜只身犯险，向埃斯科瓦尔说明要将他和手下送到波哥大的监狱，美其名曰是为了保护他不受其他犯罪团伙的伤害。埃斯科瓦尔坚持是加维利亚和爱德华背叛了自己，说自己根本就没有杀人，谁会保证自己出去不会被绑架到没过去，要真是加维利亚的意思他就应该自己来，否则任何人的擅入他都会视为宣战。爱德华被埃斯科瓦尔前行扣押在大教堂，阿里萨将军苦苦的在外等待。埃斯科瓦尔要爱德华打电话给加维利亚，让他马上将军队撤出去。加维利亚接到电话后，想不通为什么爱德华会进到监狱里，为什么阿里萨将军迟迟没有动手。所有的人都让加维利亚挂掉电话，不给埃斯科瓦尔威胁自己的机会。加维利亚十分担心爱德华的安危，埃斯科瓦尔趁机挑拨两人之间的信任。墨菲被带到了巴丘的面前，巴丘拿着墨菲的录音和照片威胁他，希望它能团结那些被伤害得人共同对抗埃斯科瓦尔。墨菲不为所动，说自己是想扳倒埃斯科瓦尔，那是在那之后会对付卡利集团了。巴丘将墨菲送了回去，墨菲抓着潘那的衣领问他是不是他出卖了自己，潘那当然不承认。晚上，军队闯入了大教堂，与毒贩们展开了激烈的战斗，成功的救出了爱德华，并及时的将消息报告给加维利亚。埃斯科瓦尔从大教堂逃出去不到一个小时哥伦比亚流言四起，但是这次没有妥协和谈判，有的只是一击必中的决心。（第一季本季终）
