1937年，日军入侵南京，烽烟中，六朝古都化为废墟，众多中国军民被困城中一支十数人的国军德械教诲队余部在长官李教官（佟大为饰）指挥下，从日军手中救出了一批教会学校女先生，而李教官等人，至此丧失了出城的时机。幸免于难的书娟（张歆怡饰）等先生前往文彻斯特教堂，随她们一同离开的，还有受雇远道至此收敛神父遗体的美国人约翰·米勒（克里斯蒂安·贝尔ChristianBale饰）。此时的南京城中，逃难的人们蜂拥进平安区和教堂寻觅庇护，十四名风尘女子强行进入教堂避难，其中知晓英语的玉墨（倪妮饰）希望借助约翰的身份为一行人提供更多维护。教堂的墙壁，并不能阻挠日军的铁蹄，教堂内的人们，将面临孰生孰死的选择……
