内森詹姆斯号越南遇袭。全世界都在从经历了恐怖的病毒袭击中慢慢恢复，在美国的密苏里州圣路易斯市，新任的美国总统杰夫瑞米切纳在通过电台向全美国人民发表讲话。而此时拯救了世界的美国海军舰内森詹姆斯号舰长钱德勒正开着车在街头，他看到了街上的人民正在慢慢的恢复正常的生活，在银行没有办法正式运作前，政府封发了配给票用来替代交易的货币。街头的建筑上也有钱德勒喷漆头像。 日本南部，因为病毒的突然变异导致美国生产的治愈药没有效果，到处都是因为病毒而死亡的人，一位老妇在一个小女孩旁边正准备给她再打一针治愈药，可是小女孩病没有撑过去，老妇看着死去的亲人悲痛欲绝。 在美国，海军军士官格林的妻子卡拉正在跟自己的丈夫在进行视频通话，但是因为一些不明的阻扰通讯没办法进行。 南海，内森詹姆斯号上正在继续着分发治愈药的行动，因为现在还有很多地区的人没办法得到治愈药，全世界的治愈药都靠着詹姆斯号进行分发。因为钱德勒当上了海军作战部部长，因此内森詹姆斯号的新舰长是迈克。 美国圣路易斯市，钱德勒拿着卡拉给他的配给票，为了纪念蕾切尔博士他们在配给票一面印上了她的头像，钱德勒看着为了研究治愈药而死亡的蕾切尔博士，他觉得无论怎样做都没办法感谢蕾切尔所做的一切。总统办公室内，外交部长跟总统正在讨论，他们觉得中国的彭主席囤积了大部分的治愈药而没有分发给周围的国家为的就是控制亚洲，但是也导致了病毒的变异从而死日本等地区大范围的人死亡。杰夫瑞总统在香港安排了一场跟彭主席的见面，当中了包括了很多亚洲其他国家的领导人。钱德勒觉得外交部长亚历克斯去比较好，但是总统却希望由他去中国香港跟彭进行会面。 内森詹姆斯号上，舰长迈克正在跟钱德勒通话，两人寒暄了一番后钱德勒告诉迈克他正在前往中国，并且告诉迈克他要去的地方暗流汹涌希望迈克多加注意。内森詹姆斯正在接近越南的领土，他们需要一个越南的当地领航员带路，因为附近有很多海盗。当地的越南领航员跟一个翻译官在内森詹姆斯号上带路，他们告诉迈克等人当地政府邀请他们去晚上的庆祝活动，越南政府想感谢他们带着治愈药到来。 此时另一边，钱德勒跟女黑客瓦尔基里乘坐的飞机到了中国香港机场，下了飞机后瓦尔基里看到了自己的爱人，狼。她没想到本来应该在悉尼的狼怎么会来接机，钱德勒表示是自己让他来这里的。到了彭的官邸后，钱德勒遇到了自己的前任萨莎，他没想到迎接自己的在中国的联络人就是萨沙。瓦尔基里凭借自己的黑客技术很轻松的搞到了这里的安保系统密码。此时钱德勒正在跟彭还有亚洲其他国家的领导人吃着晚餐，钱德勒开门见山的说出了关于治愈药的事情，彭说出了自己的看法，但是钱德勒却不那么认为。 越南当地的一个夜店里，美国海军的官兵们正在跟当地的年轻男女听着劲爆的音乐跳着舞，但是舰长迈克却对这里的气氛很反感，他希望能早点离开这里。舰长让丹尼回圣路易斯市，格林很高兴。内森詹姆斯号上，他们发现了有很多不明身份的船只以标准的进攻阵型在向他们靠近，他们决定派直升机去陆地上告诉舰长迈克等人。 越南夜店里，突然冲进来了一伙不明武装分子，他们人多势众没多久就将美国海军包括迈克等人带走了，但是格林跟博克却趁乱逃了出了，他们正准备坐上前来接他们的直升机时，却被前来的武装分子用火箭炮将飞机炸掉了。此时内森詹姆斯号上的人才发现他们跟飞机还有迈克等人失去了联系。美国圣路易斯市，总统跟下属们也得知了他们在越南受到了袭击，他们要求内森詹姆斯号立马离开越南当地等待救援。 中国香港，狼告诉了钱德勒在越南发生的事情，钱德勒跟瓦尔基里准备回去，在飞机上钱德勒突然改变主意准备回去越南救自己的船员。狼跟萨沙看到了突然下飞机的钱德勒立马赶了上来。飞机上瓦尔基里又受到了不明的信号干扰，她命令驾驶员回头。钱德勒等人却在机场看到了飞机在半空中被炸毁。
迈克等船员被海盗囚禁，钱德勒等人在机场看到了被炸毁的飞机后，他们还没来得及说什么彭的手下就追了上来准备击杀他们，狼开着车载着钱德勒跟萨莎一边与彭的手下激战一边逃离了他们的追击。 美国圣路易斯市，外交部长告诉了几人在越南发生的事情以及周边国家重要的领导人都被袭击了。卡拉告诉了总统内森詹姆斯号已经驶出了越南范围正在海上等候他们的下一步命令，但是他们并不知道失踪的迈克等人发生了什么事情。 一艘货船上，被劫持的船员们都被带到了上面。海盗们态度恶劣的将舰长迈克跟船员们关进了一个牢房里。在夜店被袭击的时候，船员梅森被海盗开枪打中了腹部，但是在现在这个情况下就算有同伴医生的帮忙也没办法处理他的伤口，几人愤怒的跟海盗要钳子纱布等东西，但是冷血的海盗又怎会听从他们的话。 钱德勒三人开着车顺利逃出了彭手下老虎的的追击，三人现在跟其他人也失去了联系，狼因为自己女友瓦尔基里在被炸毁的飞机上，他很是愤怒的有点失去理智，但是好在钱德勒在一旁，狼马上稳住了自己的情绪。内森詹姆斯号上，暂时负责军舰的军士觉得上面只是让他们驶出越南，却并没有让他们不要去追击袭击夜店的海盗，尽管同伴觉得还是要在原地等待救援的到来，可是上尉还是决定让内森詹姆斯号去营救迈克等人。 牢房内，受伤的梅森强忍着伤痛告诉同伴也许格林跟博克已经逃了出去，船医看到他的伤口还在不停的流血，几人大声的叫嚷着需要包扎的工具。这时海盗的小头领带着人强行将受伤的梅森带了出去，船员们都不知道等待他们的将会是什么。 逃出了老虎的追击后，萨莎带着钱德勒跟狼找到了一个女人杰西，她告诉两人杰西可以带他们找到飞机逃出这里。尽管杰西因为在广州发生的一些不愉快的事情打了萨莎一巴掌，但是在钱德勒的劝说下，杰西还是同意带领几人逃离这里。内森詹姆斯号上，他们通过声呐找到了当时跟踪他们的几艘船，上尉觉得就算他们能改变信号，也改变不了螺旋桨的声音。 货船的牢房内，迈克跟着船员们在用自己的航海知识分析他们现在的方位。另一边格林跟丹尼为了得知船员的去向决定活捉一个海盗来询问，两人将一群海盗引到了一个黑暗的工厂内，经过一阵激战后，一名海盗被他们拿下了，博克在搏斗中腿部中了枪伤。杰西开着车带着钱德勒等人前往藏匿飞机的地方。美国圣路易斯市，因为越南发生的事情跟现在局势的动荡，美国大部分地区的人对总统杰夫瑞的质疑越来越大。卡拉进来告诉外交部长等人现在联系不到钱德勒跟萨莎等人。 格林跟博克想从活捉的海盗嘴里得知船员的下落，但是却因为语言不通没办法沟通。杰西带着钱德勒等人到了香港的一处检查点，本来没有设检查点的地方却站满了士兵，原来都是彭的手下为了抓他们。几人都是身经百战的士兵，三两下就将香港士兵杀死了。 废旧工厂里，本以为不会说英语的海盗却突然冒出了几句英文，格林迫切的希望从他的嘴里得知船员的下落，但是受伤过重的海盗最后还是没撑过去死了。杰西带着钱德勒等人到了一处废弃的核电站，这里就是她藏匿飞机的地方。圣路易斯市，总统杰夫瑞跟彭进行了对话，彭告诉他们听听飞行员跟香港空管的对话。彭让老虎立马找到逃走的钱德勒，不要因为这个而坏了大事。杰西等人终于找到了飞机，但是却因为许久没开飞机启动不了，几人决定用汽车的电池跟发电工具，这时彭的手下老虎带着人追了上来，最后几人还是在狼的掩护下成功的坐上了杰西的飞机离开了。 格林跟博克坐上了一艘快艇，他们朝着内森詹姆斯号可能去的方向驶去，博克发射了几枚信号弹希望能在内森詹姆斯号上的船员看到，舰艇上的船员们看到了信号弹后立马朝着那个方向驶去，这时前来寻找他们的钱德勒发现了一艘海盗驾驶的船，为了营救格林跟博克，钱德勒跟狼用榴弹发射器成功的将海盗的船只炸毁了，几人终于成功的回到了内森詹姆斯号上。
钱德勒亲自带队前往山寨营救船员，在中国南海岸一个无人控制的城市，有一个鱼龙混杂的山寨，也正是海盗们的栖息地。被袭击的迈克等船员被海盗带到了这个地方，由于这个地方的特殊性，甚至连政府都没办法管辖这个地区，因此海军部长钱德勒等人在内森詹姆斯号上商量了一番后，决定前往营救自己的船员。 在海盗的山寨，迈克等人被海盗们关了起来，舰长迈克被带到了一个房间内，房间里都是各种手术器材，迈克看到这些后想要反抗，但是还是被海盗控制住了。迎接迈克等人的危机越来越近了。内森詹姆斯号上，钱德勒在跟美国总统米切纳对话，钱德勒告诉了总统是海盗带走了船员等人，钱德勒决定带人前往去营救自己的船员。最后总统同意了他的请求。 海盗山寨，迈克被海盗带到了个房间后将他固定在了床上并且将他的血抽了出来。内森詹姆斯号上之前暂时管理詹姆斯号的上尉因为错误的决定被钱德勒解除了代理执行官，并且让中尉德森来代替他的位置。杰西在维修飞机，萨莎希望能借用杰西的技术去营救迈克等人，但是杰西却认为这不是她的战斗，她执意想要离开。钱德勒想要自己亲自带队去山寨营救自己的船员，尽管萨莎觉得他这样太冒风险了，但是本就固执的钱德勒根本不会改变自己的决定。 海盗的山寨里，因为抽血过多的迈克从昏迷中醒来，意识迷糊的他还不清楚自己发生了什么，但是当他看到旁边的海盗头领（建速）正在用他的血来输血，迈克说了句你这个该死的吸血鬼后就又再一次的昏迷了过去。美国圣路易斯市，总统在媒体面前就现在国家的情况发表了演讲，其中一个记者雅各布针对内森詹姆斯号在越南跟中国香港发生的事情提问，总统不想在媒体面前对如此敏感的事件解释的太详细。 中国南海一个复杂的城市，钱德勒带领着秃鹰小队正在寻找海盗的山寨，另一边的眼镜蛇小队的两名船员也到了集结点。这个最靠近山寨的城市到处都是买卖武器的人，这里的情况由不得钱德勒等人小心翼翼。山寨里，船员们在分析着关于这里的位置信息。这时迈克被海盗带了回来，而另一个船员却被带走了。迈克将自己发生的情况告诉了船员。 钱德勒等一行人走进了城市的一个小酒馆内，萨莎拿出了一个钱币买了被白酒后将空杯子在桌上转了一圈，就被一个白衣亚洲男子带进了一个房间内。房内都是手持枪支的武装人员。萨莎跟钱德勒见到了个叫无名的中国男人面前，钱德勒用自己的手表从无名的口里得知了就是一海盗小头领贤治带走了他的船员。 山寨里，为了能更好的让船员们贡献出血液，海盗们将富含铁元素的食物都供给了船员食用。舰长迈克被允许跟海盗头领建速一起吃饭。关押船员的房间内，两名船员想要通过一处破损的排便通道逃出去确认他们的位置。另一边的萨莎等人在城市上到处找认识贤治的人，钱德勒找到了一个穿着他们船员海军服的男人，这时彭的手下找到了他们几人，钱德勒等人只好带着这个男人逃离了这里。 从牢房内逃出来的两名船员很快就被海盗们发现了，两人需要在最短的时间内确定他们的具体位置信息。另一边狼在城市里见到了彭的头号干将老虎，两人都是战斗好手打的不分胜负。逃出来的船员很快就被海盗们抓住了，不过他们也得知了他们具体位置。在城内的钱德勒等人受到了彭手下的猛烈的炮火围攻，好在这时候杰西驾驶者飞机带着个机枪手成功的掩护了几人离开。内森詹姆斯号上，萨莎告诉了钱德勒关于海盗头领建速的一些传说。
为了营救船员 内森詹姆斯号陷入鱼雷包围圈，海盗头领建速在公开的视频内播放了他们抓住的船员，并且以船员的性命威胁总统必须下令让在冲绳的两艘军舰调头离开，否则在36小时内他还会继续处决船员，并且他们都知道了梅森已经死亡了。 钱德勒等人在内森詹姆斯号上重新看了一遍船员们的视频，钱德勒发现从迈克口中说出的关于他们的编号并不是真的编号，而是经纬度。在山寨里，以建速为首的海盗们还在继续对逃跑的两个船员们进行严厉的拷打。内森詹姆斯号上，外交部长等高官还在商量到底是听从建速的要求撤离军舰或者前去营救船员。钱德勒等人在内森詹姆斯号上根据迈克几人说出的编号得知了他们被关押的地方位于西沙群岛，但是那里大大小小的小岛共有二三十个，想要从中找到山寨的位置十分困难，尽管如此他们还是决定前往。 海盗山寨，被关押的迈克等人决定再一次偷溜出去到之前发现的信号塔弄出一些动静，好让钱德勒他们发现自己位置，但是这需要任何可以传输信号的金属等工具。正在几人商量的时候，海盗们再次进来带走了舰长迈克。内森詹姆斯号派出了无人机前往弗港补给站，他们要先去给舰艇加满油，但是无人机却发现了在那里正有两艘中国的军舰。钱德勒等人知道这是彭总统的安排，于是几人决定趁深夜前往香港彭的住所。 钱德勒将这个决定告诉了美国总统米切纳。 卡拉约了记者雅各布，卡拉为了不让雅各布再继续发布对总统不利的消息进行了劝说，并且告诉雅各布除非想要詹姆斯号回到登陆密西西比的时候的样子。山寨中，被抓去继续输血的迈克发现了一个铜丝缠住的金属棒。这是建速进来了，告诉迈克美国的治愈药根本没用，导致了他的亲人朋友都死亡了，本来他也差点死去就因为输了一个被治愈的人的血液，他才得以活了下来。 这时钱德勒带着狼跟丹尼等人坐在杰西的飞机上接近了彭的住所，他们利用之前瓦尔基里的技术成功的黑入了彭住所的安保系统。几人小心翼翼的躲避了安保的巡逻，钱德勒在彭游泳的时候成功的劫持了彭。钱德勒跟萨莎几人进入了彭的房间，并且威胁了彭打电话让停靠在弗港补给站的中国军舰离开了那里。另一边记者雅各布还在对死去的梅森采访了他的母亲，这更加剧了美国社会对总统的能力质疑。 彭的住所，钱德勒告诉彭是建速绑架了自己的船员，彭也表示自己一直在寻找这个海岛头领建速。这在这时老虎前来彭的房间巡查，彭因为自己的安全并没有告诉老虎钱德勒等人在这里。钱德勒三人在撤离彭住所的时候被老虎的人拦住了去路，但是这时彭出来让钱德勒几人离开了这里，并且告诉手下这里从没有美国人来过。 在山寨里，建速也很快的发现了之前迈克说的编号其实就是经纬度坐标，建速告诉迈克他这是在把内森詹姆斯号上的人带上绝路。这是内森詹姆斯号接近了山寨的岛屿，但是他们却陷入了鱼雷的包围圈，迎接他们的将是很严峻的挑战。
内森詹姆斯有惊无险的通过了水雷的海域，内森詹姆斯号在前往山寨的路上不经意间就进入了海盗们布置的水雷海域，钱德勒下命令马上进入Z状态，开启一级战备状态，他们猜测这些水雷肯定是海盗们为了保护山寨设置的障碍。在美国圣路易斯市，总统再次召开了记者会，但是记者雅各布还是不不依不饶的提出关于詹姆斯号发生的事情。 海盗山寨，建速得知内森詹姆斯号已经进入了他们的水雷包围圈，他告诉迈克等人今天他们追捕的是更大的猎物就是内森詹姆斯号，迈克跟同伴看到了海盗们今天运来的一枚巨大的鱼雷，他们知道这就是用来对付内森詹姆斯号的。 内森詹姆斯号上，经过商量钱德勒决定派几个得力干将带上潜水等装备去海里将阻碍他们前进的水雷一一清除，因为已经有三枚水雷在慢慢向他们的军舰靠近了。狼带着几名船员潜入了海中，很快他们就发现了一个个巨大的水雷用铁链相连着。狼将水雷的情况告诉了钱德勒跟萨莎等人，他们都发现这种水雷是自制的水雷，就在这时狼发现了水雷里有个装置，钱德勒马上告诉其他船员不要轻易行动，但是为时已晚已经有个船员因为拆除了水雷导致爆炸，这名船员也因此牺牲了。 海盗山寨里，建速的妻子因为怀孕的同时还发烧得病，因此建速喊来了随同迈克等人的船医。船医看过建速妻子的病情后确认她得了疟疾。因为拆除水雷失败后了还牺牲了一名队友，狼等人很是生气的回到了内森詹姆斯号上。几人发现了水雷的装置里有类似发动机的东西，他们觉得水雷在慢慢向他们靠近。美国圣路易斯市，美国总统正在跟负责几大区域的领导人谈话，他们都知道了詹姆斯号现在的情况，几人要求马上废除配给票的制度，不然他们控制不住民众的愤怒，总统杰夫瑞告诉几人如果他们还没办法控制住人民的情绪，他会采取武力手段来解决。 圣路易斯市，卡拉为了阻止雅各布再次针对这次事件的报道她答应让雅各布有机会跟总统一对一的采访。钱德勒等船员们决定了通过飞机牵引鱼雷诱饵的方式来引爆水雷，为此给詹姆斯号扫出一条安全的通道。但是如果全靠杰西的飞机还不够，因此他们决定再将另一枚鱼雷诱饵绑在快艇上的方式来解决。 狼跟一名船员开着快艇，而杰西则带着萨莎等人在飞机上。两队人马很快就按照计划引爆了大部分水雷。就在这个时候，建速发射来的鱼雷冲向了内森詹姆斯号，因为在军舰周围还有很多水雷因此詹姆斯号没办法躲避，狼跟船员为了阻挡水雷开着快艇冲向了水雷，顿时海面上的引发了一次大爆炸。钱德勒跟船员们都在寻找着当时在快艇上的狼跟同伴，就在他们以为两人已经凶多吉少的时候，博克发现了漂浮在远处的狼跟同伴，整个团队的人都兴奋不已。
钱德勒带领队员成功的解救了迈克等人 科鲁兹牺牲，海盗山寨里，迈克等人发现了海盗们的动静很不寻常，他们知道这是因为内森詹姆斯号已经接近他们了，因此海盗可能是要转移位置了。军士长要求女轮机长工程师拿着之前偷来的铜丝去发射塔让同伴知道他们的位置。这时海盗们进来让几人都出去干活，女轮机长故意留在最后。 海盗山寨，建速的手下户城很不满意他们要躲避美国海军，他希望能跟海军一战，但是建速心系自己妻子的安危并不想冒险留下。因此他安排了迈克等人一起跟他们搬运货物。迈克故意一边走一边你跟户城聊天，女轮机长趁机脱离了队伍，她一边跑一边数数，没多久她就发现了那个信号发射塔，就在女轮机长将铜丝插入的时候，另一边的内森詹姆斯号上的人发现了无线高频段有信号干扰。 建速发现了女轮机长不在队伍当中，他马上派人到处寻找她的踪迹，这时女轮机长刚好回来了见到了在一旁搬东西的建速的妻子京子，她希望京子不要揭发她。这时建速找到了这里，善良的京子并没有揭发女轮机长的行踪。内森詹姆斯号上，钱德勒等人决定了前去信号发射的地方营救自己的同伴，他们装备好一切后并且告诉了白宫后就出发了。圣路易斯市，美国白宫内，总统跟记者单独对话。 钱德勒带着狼，萨莎还有几人登上了海盗山寨，他们很快发现了关押同伴的营地，但是几人进去后却发现营地空无人烟，却不知道房子的地下还有个通道，里面就躲着户城跟几名他们的同伴。圣路易斯市，总统准备好了演讲稿用来应付接下来会发生的事情。钱德勒等人很快发现了海盗的行踪，他们沿着踪迹一路寻找，而躲在通道里的京子却因为身体虚弱需要治疗，户城不相信美国海军船医，他坚持只要给京子输血就够了。 钱德勒等人在寻找海盗的踪迹时受到了不明的攻击，可以他们却发现不了任何敌人的踪迹。迈克跟军士长几人被建速关押到了另一处地方，迪亚兹用之前藏起来的道具想要挣脱绳子的束缚。另一边的钱德勒等人因为发现不了敌人的踪迹他们很是小心翼翼的前进，但是这时同伴巴特勒还是被不明的敌人开枪打死了，就在这时钱德勒发现了敌人的踪迹，几人赶忙追了上去，他们发现了一个海盗的隧道，这才知道他们就是利用隧道这样偷袭他们的。 在房子的地下通道里，船医给京子输血的时候想要趁机偷走海盗的枪，但是没有成功。迪亚兹成功的将束缚双手的绳子隔断并且逃走了，钱德勒等人在迪亚兹的带领下找到了建速等人，他们通过密切的配合成功的解救了迈克等人，但是建速却逃走了，并且科鲁兹也在战斗中死了。迈克告诉了钱德勒其余的同伴都被户城关押在了另个地方，钱德勒知道那就是地下通道，以此同时，内森詹姆斯号发现了有人将他们的无人机打落了。 钱德勒几人在迈克的带领下回到了营地，他们遇见了前来的国安局的人，两队人马展开了激烈的枪战，杰西开着飞机载着博克前来支援几人，但是因为树木茂密博克没办法瞄准，于是他们决定让内森詹姆斯号瞄准他们的位置发射舰炮，在炮火接近的那一刻杰西成功的开着飞机躲避了炮弹，炮弹成功的击中了彭的手下，也因此让钱德勒等人成功的脱困。 海盗地下的通道里，船医跟米勒趁机杀死了户城跟几名海盗，但是米勒在路上被赶来的建速劫持了，这时钱德勒跟迈克也赶到了这里，京子说服了建速为了她跟孩子着想。同伴都安全的回到了内森詹姆斯号上，钱德勒得知中国的军舰就在附近。
詹姆斯号逃离了中国军舰的追击 美国总统杰夫瑞自杀，内森詹姆斯号上，众人都因为克鲁兹的死而沉浸在悲痛之中，尽管他们成功的回到了詹姆斯号上，但是却也因此失去了一个战友。在饭厅里，几人都因为克鲁兹的牺牲久久不能释怀。钱德勒跟迈克等人觉得在他们后方的中国军舰很有可能就躲在之前的海盗岛上。 海盗头领建速被关在了内森詹姆斯号上的一个房间内，这时钱德勒来看他并且将他手上的手铐解了下来，钱德勒想从建速的口中得知为什么当时他会知道迈克等人在越南的夜店里。建速并没有告诉他，只是说美国人毒害了他们的国家，钱德勒告诉建速正是他们的水手带去了治愈药，但是建速却说那根本不是治愈药而是毒药。钱德勒说了一句等回到美国，他就会以引发军事战争而受到处罚，建速却不以为然。 建速的妻子因为怀孕加上得了疟疾因此她正在船医的治疗下慢慢康复，钱德勒希望船医能尽快测试出他们血液中治愈药失效的原因，但是船医却表示即使现在有完善的医疗设施他也不是斯科特博士，听到这句的钱德勒只能让船医尽力就好。内森詹姆斯号上，电子系统侦测到了前方有好几艘中国的军舰，他们得知这肯定是彭的军舰。内森詹姆斯号马上启动了灯火管制。尽管中国军舰离他们很近，但是却并没有马上发现他们，内森詹姆斯号马上通过周围岛屿的掩护成功的离开那片海域。 美国圣路易斯市，美国总统杰夫瑞跟卡拉等人都在努力的想要联系到内森詹姆斯号上的人，却因为不明信号的干扰没办法成功。 内森詹姆斯号上，钱德勒带着迈克拿着新鲜的血液输血给建速，迈克跟钱德勒想要知道到底他们的治愈药送到日本后发生了什么。建速告诉了当时发生一切，并且告诉钱德勒跟迈克这一切都是在他的眼皮底下发生的，并不是任何人做过手脚。建速说他并没有跟彭做过任何交易。在一间监狱内，因为当时带领天生免疫人群的首领柯蒂斯现在被关押在这里，正是他杀死了斯科特博士，记者雅各布记录下了柯蒂斯所说的话并且将录像放给了美国总统等人，正是因为当时的总统杰夫瑞将自己已经患病的儿子带到了体育场，才因此引发了病毒的大范围传染。 因为内森詹姆斯号正处于两艘中国军舰的中间位置，双方都以为对方是自己的人，他们正在努力的通过对话联系，但是只要再过些时间就会发现了中间的美国军舰，为了争取时间钱德勒故意拿起来了对讲机按钮按了几下，就这样他们在经过一个岛屿的时候将军舰停了下来，但是两艘中国军舰并没有放弃。圣路易斯市，美国总统发布了电视讲话，公开承认了当时他所做的一切。 内森詹姆斯号上，船医就要给京子做手术因为她的孩子就要出生了，丹尼跟萨莎等人也赶来帮忙，另一边钱德勒带着建速到了产房的门口，钱德勒告诉建速是否给刚出生的孩子打治愈药由他自己决定，当孩子出生的那一刻，建速同意了钱德勒的要求。建速抱着自己刚出生的儿子很是激动。 因为中国军舰就要发现了他们的存在，钱德勒等人答应了建速的掌舵的要求，建速成功的驾驶内森詹姆斯号离开了水雷区。摆脱了中国军舰的追击后，钱德勒联系上了卡拉，但是卡拉发现了已经自杀的总统杰夫瑞。
新任总统上任 钱德勒等人发现治愈药无效的原因，美国圣路易斯市，总统杰夫瑞的自杀令所有人都没有想到。在总统的悼念会上，很多人都来悼念总统，记者雅各布也对此事件进行了报道。白宫里，大家得知副总统奥利弗在前往圣路易斯市的路上。 内森詹姆斯号上，船员们升起了美国国旗用来悼念美国总统杰夫瑞。中国主席彭也发表了自己对总统自杀悲痛之情。钱德勒看着假惺惺的彭很是愤怒的想要杀死对方，但是萨莎跟迈克都觉得现在这样做是不明智的。卡拉跟美国高官艾莉森看到了关于副总统奥利弗在圣路易斯市很受民众的爱戴。 内森詹姆斯号上，船医跟船员们都在寻找斯科特博士留下的一些重要器材用以研究病毒的变异，他们找到了斯科特博士留下的日记，船医觉得这是个好的开始。京子让萨莎帮她翻译，为了感谢丹尼救了他们母子的性命，京子觉得丹尼是个很有天赋的男人。圣路易斯市白宫，副总统奥利弗来了，奥利弗说了一些鼓舞大家的话就坐在了总统的位置上，并且希望能跟钱德勒对话。 钱德勒告诉奥利弗他们正在接近一个山寨的私人港口，他们想要找到一个叫吴明的走私犯，韦德就是找出这一切开端的原因，奥利弗同意了钱德勒的要求。丹尼带着狼等人准备前去抓捕吴明，军舰上的其他同伴们也在配合着。杰西在飞机上发现山寨已经被彭烧毁了。钱德勒知道吴明也许还没死，建速说了一句“儿行千里，母担忧”萨莎翻译了这是一个中国的谚语，他们从此得知了也许能从吴明的母亲那里下手。 新人总统杰夫瑞希望能从詹姆斯号上得到被救的船员清晰视频，只有这样才能让民众放心，但是始终被不明的信号干扰阻碍了。另一边钱德勒带领的秃鹫小队已经到达云马了。几人趁着黑夜小心翼翼的前进，钱德勒从夜视仪望远镜中得知吴明被彭的手下控制住了，干掉了几个守卫后他们进入了房间，这时狼又碰到了彭的手下老虎，两个一直未分出胜负的对手再一次激斗在了一起，最后狼成功的杀死了老虎。 吴明将之前的手表还给了钱德勒，钱德勒觉得吴明一直在隐瞒什么。丹尼跟狼发现了挂在墙上的彩票，其实这上面都记录着一个坐标。美国圣路易斯市，各区域的负责人都希望奥利弗能尽快解决关于配给票的问题，艾莉森觉得杰夫瑞总统关于配给票的做法弊大于利。内森詹姆斯号上，船医通过斯科特博士留下的一些资料，得出了一些结论。 通过彩票上的标记他们找到了一艘货船，但是并不是他们需要找到的那艘船。就在这时他们在飞机上发现了一艘游艇，上面的编号跟图案正是他们一直要寻找的。钱德勒通过对话希望能上船检查，但是开船的人却反而加快了速度想要逃走，内森詹姆斯号发射了一枚机炮用来吓唬游艇，杰西开着飞机逼停了游艇并且找到了一堆的海洛因，萨莎从装有海洛因的柜子里找到了一个导弹。在拆弹过程中，导弹里冒出一种绿色的迷雾，萨莎说当初从京子那里得知出现过这种烟雾。船医通过分析迷雾得到了一些重要的消息。
里韦拉被杀死 艾莉森控制了总统。在越南的一家工厂内，工人们都在忙着制作弹药，原来这就是彭手下的人，他们将可以让治愈药失效的绿色弹药装在了导弹内再发射到各地。就像红流感一样，它降临的悄无声息，所到之处，只要是没有事先已经打了治愈药的人们都会受到感染。 几名越南士兵在中越边界遇到了一枚炸弹的袭击，但是炸弹落在了他们的附近却没有爆炸，就在他们以为这是一枚哑弹的时候却发现了空中早已弥漫了一种绿色的雾气。尽管此时疾控中心的人带着治愈药前来，他们渴求得到庇护跟救助，但是为时已晚整个国家都陷入了灭亡的危机，人们都因为治愈药的无效而死去。钱德勒将这些消息告诉了新任的总统。他们知道这些导弹都是从叫帕莱索的小岛发射的，于是在征得了总统的同意后，他们准备前往小岛。 美国圣路易斯市，白宫内卡拉找到了技术分析员丹尼斯，并从他那里得知了一直以来干扰他们信号的波段是一个由人发出的声音。詹姆斯号上，建速找来了舰长迈克，她告诉迈克他有人人手跟船只并且熟悉这一片海域，他希望能帮助他们，但是迈克只是让他好好休息就离开了。钱德勒带着秃鹫小队登上了导弹发射的小岛，几人很快就发现了一个导弹发射台，但是本来空无一人的地方却出现了一个拿着高尔夫球杆的亚洲男子。 男子告诉钱德勒等人，他们带着很多来逃避病毒的人来到了此处建立了学校农场。男子带着几人来到了他们的居住中心，这里的一切显得那么安详和平，有很多来避难的家庭都在这里居住着，男子带着钱德勒等人到了一处纺织工厂，里面的工人都在做着织布缝纫的工作，卡拉这时发现了一个在工作的女子的异样。但是这个并不是钱德勒他们想要找到的工厂，就在这时一个小女孩追着一头小狗路过，丹尼追上了上去，小女孩告诉了丹尼等人这里并不是他们想象的那样，其实他们在这里都是为了制作弹药而成为奴隶。 男子被迫带着钱德勒等人到了一处大门紧闭的工厂，钱德勒命令詹姆斯号将导弹对准工厂。就在这时男子被冲出来的士兵杀死了，钱德勒等人通过一番激战成功的杀死了几名敌人，他们进入了工厂后发现了这里就是制造导弹的地方，但是早已经被人转移走了，萨莎发现了导弹都已经被运往韩国的仁川了。 美国圣路易斯市，卡拉发现了国务卿里韦拉，卡拉从里韦拉的话中听出了一些端倪，但是她并没有从中猜到什么重要信息。卡拉跟丹尼斯从干扰信号中分析出了一组语音代码，重要的是这组信号是从他们所在的楼内发射出去的。并且卡拉跟丹尼斯通过分析得出了一组重要的信息，这些代码都指向了曾经钱德勒等人被袭击过的地方。 在海上，准备前去追捕中国军舰的钱德勒带着沙克顿号跟海华德号受到了中国的导弹袭击，最后导致了沙克顿号的沉没，而海华德号上的官兵也都落入了海中，钱德勒带着众人将剩下的生还士兵救到了内森詹姆斯号上。 美国圣路易斯市，卡拉一路跟踪里韦拉到了地下停车场，却没想到里韦拉被随后而来的几人杀死了，而另一边的艾莉森也已经将总统控制在了自己的手里。
卡拉手忙脚乱的准备东西，外面山姆的车已经到了，卡拉把孩子的东西放在车上，眼睁睁的看着样子离开心里飞航不舍。萨沙正在为一群士兵包扎，满屋子受伤的人屋里充满着血腥味，士兵报告梅朗舰长发射的时间到了，梅朗舰长看着对方舰队心里舍不得。斯莱特里舰长接过手中的发射器按了发射按钮，对面的舰队冒起了火光，滚滚地浓烟和昏黄的天色相接。舰队的长官聚在一起商量可行性的办法，部分长官担心众人就这样干等着。信号分析室从中国驱逐舰海龙号上截取了通讯记录，舰长看到后向决定击沉它，但是又担心密码还在船上。众人希望回国，钱德勒舰长认为只要彭还活着就是威胁，安排格林上位组织组织小队去搜索驱逐舰。总统奥利佛上任48小时接受记者现场采访，记者反问他为何要撤销前任总统的制度，奥利佛哑口无言，艾莉森告诉众人奥利佛的目的是建立更强大美好的美国，鉴于近期奥利佛工作的缘故，工作汇报将会有简报小组完成，记者们显得有些不满意，艾莉森果断的回到了办公室。这时她接到了卡拉寻求帮助的电话，自己亲眼看到里韦拉被杀害，怀疑白宫内部有鬼。艾林森叮嘱卡拉别离开等待自己的到来。当杀手赶到sw餐厅寻找卡拉时，卡拉站在对面街边看到了一切，幸好自己提前有所防备不然就被杀人灭口了。卡拉把事情的真相告诉记者雅各布，希望他去贝蒂房间查线索。艾莉森听到杀手并未找到卡拉非常失望，罗伯塔提醒她要尽快处理，艾林森认为事情没有自己谋划罗伯塔不能坐上谋事的职务，罗伯塔气冲冲离开了房间。艾莉森带着文件让奥利佛签字，奥利佛明白她是想用外部力量铲除钱德勒，为了国家的利益他不愿意签字，但是却拗不过艾莉森掌握的权利。埃里克找到素盏鸣尊帮忙寻求彭的消息，很快素盏鸣尊传来彭和海龙驱逐舰的通话记录，彭不在中国而是在驱逐舰上。梅朗舰长接到白宫命令逮捕钱德勒舰长，钱德勒舰长认为白宫内部出了问题， 自己在24小时前和奥利佛通话，奥利佛表全力支持自己。梅朗舰长不听解释坚持口押他。钱德勒舰长交代麦莱特里舰长一定要维持要秩序，梅朗宣布格兰德森中尉、梅吉亚中尉被免职，然后下令返回珍珠港。雅各布到白宫寻找线索，贝蒂房间的东西被清理。卡拉只好打电话丹尼斯帮忙，几分钟后丹尼斯把贝蒂日程表中夹杂隐藏文件拷贝出来，卡拉发现地图上许多区域被画上了红点，红点区域是监狱，卡拉认为艾莉森控制了军队。当丹尼斯离开时，卡拉希望他给钱德勒发消息时候注意安全，丹尼斯刚离开，杀人冲了进来，卡拉利用雅各布墙角的猎枪杀了他，然后带着雅各布逃亡其他地区。第二天新闻上报道雅各布、卡拉与参议员贝蒂的死有关，卡拉发现士兵们正在建立墙，这正是最高统治者们正在瓜分美国的表现。舰队上发生了暴动，士兵趁机偷走了梅朗身上的钥匙，麦莱特里从保险柜里拿出了手枪，萨沙配合麦莱特里的行动解救了钱德勒舰长。钱德勒、萨沙主动去应对梅朗等人的审判，另一边麦莱特里拿着没有子弹的枪带着士兵们控制了内斯.詹姆斯号。
