进入正化年间（始自1989年），为了改善混乱蜕化的社会习尚，日本政府发布《媒体良化法》，并成立特殊部门对一切可以影响世人身心安康的书籍中止查封与销毁。可与此同时，言论自在也遭到粗犷遏制和打压。为了捍卫自在思想，名为“图书馆自卫组织图书队”的组织应运而生，他们为了维护书籍拿起武器，许多人为此献出生命。高中时代曾被视为“王子大人”的图书队员相助，热血女孩笠原郁（荣仓奈奈 饰）决意参与图书队，可是担任训练她的二等图书正堂上笃（冈田准一 饰）似乎总有意刁难笠原，而女孩照旧仰仗自己的努力成为一名图书特殊部队成员。在接上去的日子里，笠原和堂上教官、同期手冢光（福士苍汰 饰）的友谊和信任日益加深。未过多久，左右言论自在的严重事情到来，图书队和媒体良化队宿命的战争拉开大幕…… 本片依据有川浩的“图书馆系列”的第一部改编。
