故事发作在被天空之壁分为三区块的《幪面超人BUILD》的世界，居然出现了《幪面超人EX-AID》世界的冤家怪人崩源体：为何不该出如今这的冤家会分开这世界？面对微妙冤家而毫无应对方法的战兔，一个身体半边被金属掩盖的神微妙男人出如今他眼前。自称迷信家的男人启动了庞大的机器，上空竟出现了倒立的另一个世界。另一边，EX-AID的世界也发作异常的状况。有天空之壁的世界正逐渐的坠落到 EX-AID的世界，距离两个世界抵触碰撞的时间还剩下24小时。世界末日的倒数末尾…！面对史无前例的危机，能援救人类的只需那群战士。凌驾前作的规模，前所未见的举措局面，不该有交集的英雄们终于相遇。谜团重重的故事行将解开——
