奥秘工厂深夜突发新奇案件，一名员工新奇惨死，人人都传是不知名异兽所为，一时间案件变得神乎其神。国际知名灵异侦探社接到被害人家眷的委托，介入此案调查，却被一系列假线索误导，将凶手锁定在厂长身上，但是厂长在不恰当的机遇自杀，使得案情愈加虚无缥缈。厂长死后，其女儿光子将侦探社社长何告上法庭，招致侦探社堕入信誉危机。
预见到此事的复杂水平后，何生派出保镖风泽和电脑高手小弥调查涉事工厂，发现厂长死于谋杀，并将调查对象锁定在了工厂的技术顾问长谷川身上。调查证明长谷川的真实身份是日本的通缉犯，并且与漂泊汉失踪案有关。与此同时，光子放下了对何生的成见，与他一同调查案件。
何生等人深化敌穴，发现工厂的真实面目是一个大型生物实验室，并且和一个国际组织有牵连，异兽杀人的谜底呼之欲出。但是长谷川在关键时辰叛变，指出幕后主使另有其人。长谷川为何受人指使，终究谁才是唯恐天下不乱的“奥秘人”？
