《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生收回的短片组成，各篇的角度与作风各异，制造班底集聚了日本,美国,韩国三地的动画精英《机器复兴》讲述了MATRIX的历史机器人不堪人类恶劣看待，终于统一并将人类化为动力。《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的呼唤，而大批黑衣人末尾对他展开围捕。《虚拟顺序》展现了一对男女在虚拟训练顺序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运发起在接近打破人类极限时终被系统牢牢控制。《跨越极限》叙说由于系统错误，安静的街区中出现了一片超凡区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕捉并驯化的故事。《终极战役》记载了一艘飞船消灭的经过。
