宋慈屡破奇案，成为提点刑狱司。娶得唐恩与聂枫两位妻子本应美满幸福，宋慈带同怀有身孕的妻子到湖南上任，途中破了一宗孝媳为免家姑再受痛痛折磨，遂下霉了断家姑性命的命案，竟令两位妻子葬身火海。宋慈伤痛，辞官归隐，不过老天爷似要开他玩笑，途中遇上暴风雨，宋慈以为自己必死无疑，可与死去妻儿团聚。松山县捕快展杰在沙滩发现奄奄一息的宋慈，将他运到邹子龙负责看守的义庄。子龙一时贪心盗取宋慈的玉佩，反令宋慈恢复知觉。替死人化妆的纸絮铺太子女阮玉珠与子龙返义庄，见宋慈拿着菜刀走向一怀孕女尸，以为他对女尸有不轨企图，即上前阻止，原来东慈只为女尸接生，二人因误会而结下不解缘。玉珠因为与她订亲的男子皆病死而有“劏猪凳”之名，她有一好姊妹杨丹凤，其母香姑号称可请鬼，宋慈欲与亡妻诉衷情，终因没钱而被拒。曾对宋慈有一包之恩的牛嫂被控谋杀亲夫，宋慈愿替她申冤。验尸期间，玉珠误中有毒的针昏迷。
宋慈喂玉珠吃极臭之药，令她呕吐大作，连毒也一并呕出，子龙笑指玉珠这个“劏猪凳”敌不过宋慈这个“棺材仔”，不知谁克谁。宋慈隐瞒为牛哥验尸一事，并不断给子龙提示，令他找出牛哥死因替牛嫂平反。宋慈欲离开义庄，子龙再三挽留他。玉珠将辛苦储来的钱购买燕窝给母补身。宋慈为救差点被米袋压伤的小朋友而推跌玉珠，令玉珠的燕窝被偷去，玉珠气结。宋慈见玉珠母王秀娴病重，遂留下来帮手打理纸扎铺生意，以还燕窝债。宋慈与玉珠到妓院收数，见妓女及嫖客狂性大发，不停地笑及跳，更弄伤玉珠，众人以为是狐狸精作怪。丹凤与香姑决定上演一幕驱赶狐狸精的法事，遂找子龙扮狐狸精上身，以取得在妓院驱妖的生意。当香姑及丹凤做完法事，子龙竟威胁要说出真相，丹凤不甘被威胁作弄他。子龙气极带宋慈去揭开客人发狂真相，几经纠缠子龙与丹凤双双中毒，大吵大闹，幸宋慈及时出现救了二人的性命。子龙到城西赌钱途中偶遇玉珠同父异母妹玉宝，被她的美貌弄致神魂颠倒。未几，子龙遇上丹凤摆买护宅神镜，因光线问题，丹凤望不见子龙，而子龙却以为她见到自己。秀秀被发现浮尸河中，宋慈与玉珠同为秀秀化妆，但宋慈发现其颈上的瘀痕，推断出秀秀不是自杀，而且怀有身孕，但其父母不信。
玉珠到衙门击鼓为女尸秀秀伸冤，为秀父温世亮所阻，世亮与玉珠公堂外纠缠，宋慈赶至替玉珠解围，争吵间惊动展杰等人，世亮反指玉珠意图勒索，宋慈和玉珠与世亮对薄公堂。公堂上，宋慈举出秀秀尸体各样疑点，但一一被世亮驳回，宋慈突感头痛未能作出回应，反累玉珠与自己被打。受刑之际，宋慈提出可解剖秀秀尸看看是否有孕，更说如果所指有错，他与玉珠一同受罚。宋慈在公堂上剖尸，终证实秀秀有孕，而宋慈再提出秀秀不是自杀而是被谋杀亦得到再验证。宋慈请玉珠吃粥赔罪，得玉珠介绍，宋慈认识粥铺老板明叔。展杰从世亮口中得知秀秀配戴的玉佩不见了，展杰与众捕快遂四出寻找失去的玉佩，竟在当铺发现子龙曾将秀秀的玉佩作抵押，子龙成为杀秀秀的嫌疑犯，不久展杰拘捕子龙。樵夫在公堂指出曾在河边见到子龙与秀秀在河边谈及怀孕一事，令子龙嫌疑更大。子龙提出在城西赌钱时曾见丹凤，但她在公堂作供却说没有，二人对骂，最终子龙受刑，一时说出见过一个手执“美人出浴扇”的女子。宋慈与玉珠到樵夫家查案，发现樵夫是撞聋。展杰四出寻找携扇女子。得知国色天香楼的妓女白如梦曾购买此扇，遂往查探，岂料被当嫖客，更没有钱付花酒钱，其父展坚得悉此事大怒。如梦说出曾遇一位与自己拿着同一款式扇的女子，展杰等终寻到此女子——阮玉宝，玉宝蒙头到公堂证明曾见子龙，子龙无罪释放。
子龙对宋慈说出玉珠与玉宝的关系，原来玉珠母秀娴被玉宝母淑兰陷害而被赶出家门。丹凤往找玉珠遇上子龙，仇人见面分外眼红，二人又起争执，宋慈以秀秀鬼魂吓到他们停止争拗。丹凤到温府打斋，见温夫人面青唇白说：“救我！”其后更知秀秀本姓不是温，世亮砌辞说夫人忆女成狂。展杰请宋慈覆验尸体，但竟发现世亮已私自取回秀秀尸体，宋慈等在街头要求世亮交出尸，大家争持不下，惊动展坚，宋慈搬出“捡尸法则”中如被杀者未找出真凶，不能安葬，松山县纪大人终在一堆公文中找到这法则，秀秀尸体终可再覆验。宋慈在秀秀背上找到伤痕，再加上听到丹凤所说秀秀本姓不是温，展杰、宋慈和子龙决到温府一趟，在府中书房找到杀人凶器，真凶终被捕。但凶手在公堂上继续反驳疑点，宋慈遂读出覆验纪录，凶手杀人证据确凿终被绳之于法。纪大人聘请宋慈为忤作，但遭他拒绝。玉珠、子龙等讨论宋慈为何不做忤作，凑巧外面雷电交加，宋慈想起为人伸冤令自己家散人亡一事，头痛大作，更说：“我最憎做忤作，最憎对着死尸，最憎行雷闪电！”玉珠与人发生争执，宋慈指玉珠不应摆出凶恶样，更以自己惨事安慰玉珠，令她感动不已。丹凤为生计到国色天香楼应征做打杂，被嫖客误为妓女，幸得如梦解围。玉珠和丹凤遇上玉宝及淑兰，众争持不下，玉宝竟当众扮可怜，子龙见状为玉宝出头。玉珠煲汤给宋慈饮，宋慈推搪时展坚再亲自游说他做忤作，为尽早还清欠玉珠的款项，宋慈答允再任忤作。
断足命案令镇内人心惶惶，衙门疲于奔命仍末缉拿真凶。一夜子龙在等候玉宝时见宋慈经过，这时玉宝与淑兰突然被蒙面人袭击，幸子龙拚死相救。宋慈则在巷中遇见蒙面人，但未及擒拿。此时又一女子被割颈及斩足而死。宋慈验尸时凭凶手斩足的手法及残留的当归气味，断定凶手应是厨师，遂找全县厨师让玉宝认人，但玉宝未能认出，案件胶着。子龙从宋慈的物件中找到当归及红鞋，认为凶手是宋慈。子龙打晕宋慈后去通知展杰。此时真凶来到正欲置宋慈和珠于死地，幸展杰等及时来到，真凶终于落网。子龙在玉宝面前吹嘘捉凶手经过，玉宝知义庄多异乡客尸体，但经费不足，玉宝认为是扬名的好机会，假仁假义说要搞斋宴起义冢，得乡民赞扬。宋慈再次头痛晕倒，被诊断出脑部有瘀血，若不清除会有生命危险，需用梅花神针救之，刚好神针传人郡马夏侯国栋在附近出游。玉珠知道后决定带宋慈求医，却苦无路费。当村民知悉后，立即筹钱给宋慈上路。好不容易才找到国楝，国栋施针后表示因部分针法早已失传，他只能暂时控制宋慈病情，未能彻底根治，众失望而回。回村后珠发现粥店老板明叔竟是神针传人，但他有难言之忍，未答应医治宋慈。然在玉珠大力恳求下，明终于答允医治宋宋慈，但玉珠必须保守秘密，不能透露明的身份，玉珠为求救宋慈遂答允。
宋慈终于醒来，明叔谓尚欠数针便可医好宋慈，并劝宋慈既然天赋才能且多次不死，证明上天对宋慈另有安排，不应放弃生命，宋慈听后决心重新做人。宋慈得以不死消息传出，令国栋又惊又怒，并猜出谁懂得神针。国栋揭穿明叔身份，指出他同明叔本是师兄弟，而明叔原是太医，但在医治骁骑大将军时因落药太重令将军死亡，继而成为逃犯。国栋要求立即处死明叔，但众人力求要明叔必先医好宋慈。宋慈在听明叔的证供后，认为案件有可疑，决定为明洗冤。宋慈与子龙偷入将军墓地开棺验尸，反被少将军马伯豪与国栋捉住指二人图谋不轨。宋慈被迫公开身份并念出他所写的验尸守则，但众人仍不信，国栋更大力阻止宋慈为明叔翻案，伯豪答允给宋慈五日时间让他的验尸守则由京城送到衙门以作证明。宋慈等奇怪国栋为何阻止翻案，认为将军之死另有内情。展杰与展坚赶到驿站找送手稿的士兵，双方发生冲突，为展杰抢去手稿并送往衙门。时明叔在狱中正要为宋慈施最后数针，国栋突领兵到来捉明往处斩，幸手稿送至，宋慈冒头痛写字以证明身份。当确认宋慈身份时，紫霞郡主到并力指宋慈是假冒，要求处斩明。在最后关头送手稿士兵表明身份，竟是十皇爷。宋慈身份终于得到证实，明终于可以翻案。宋慈重新验尸，他以煮骨法发现骨中竟暗藏毒针，谋杀将军的是另有其人。
十皇爷重审骁骑大将军之死一案，宋慈在覆验将军尸时发现有芒钉留在尸身，从而推断有人插赃嫁祸明，真凶终绳之以法。就在处斩时，紫霞郡主带同紫龙袍往救之，狂风吹起紫龙袍，真凶最后难逃天谴，众人劝宋慈留下为冤案伸冤，十皇爷着宋慈留在松山县担任提点刑狱司，宋慈最终答允。宋慈见到一玉佩酷似亡妻唐思的遗物，慨叹玉佩已失，玉珠听在耳里决为他寻找。玉珠得知玉佩在一饰物店出现，即与丹凤前去，铺中遇到玉宝，玉珠为替宋慈取回其妻的玉佩而与玉宝冲突，丹凤更间接令玉宝面部受伤。玉宝告上衙门，丹凤被逼入狱三日候判。宋慈指自己心如止水，叫玉珠不必对自己太好，玉珠大为失望。玉宝着子龙引见宋慈，并归还玉佩，宋慈代丹凤向玉宝求情。公堂上，玉宝伤势痊愈，但亦不放过丹凤，玉宝要求丹凤赔偿一百两。丹凤大感为难。斋宴举行前，富商关万福首次与玉宝见面，对她伪装的天使面孔大为欣赏。斋宴上丹凤提出以卖头发筹赔偿金，宋慈带头捐钱及富翁关万福支持，丹凤终可赔偿玉宝，丹凤向宋慈道谢他，也与子龙冰释前嫌。关府发生侍婢跌落井命案，宋慈调查证实关夫人诬衊侍婢偷玉珠钗，侍婢看不开寻死。玉珠帮侍婢化妆时不慎弄伤手，宋慈冷淡地叫玉珠自行治理。
玉珠对丹凤诉说宋慈对自己的冷淡，丹凤说神女有心襄王无梦，玉珠帮展杰母吕氏弄干净衣服，令吕氏对玉珠留下极好印象，吕氏欲撮合玉珠与展杰，令展杰与玉珠不自然。展杰在酒楼再碰见如梦，展杰多番回避，丹凤被嫖客留难，幸得如梦解围，展杰看在眼里，觉如梦有情有义。玉宝落选秀女选举，子龙以为玉宝欲跳崖轻生，连忙阻止。玉宝叫子龙拜宋慈为师，学习验尸技巧可日后成为提点刑狱可，更说将自己的将来交给子龙，子龙听后心如鹿撞决定发奋。子龙在众人前拜宋慈为师，宋慈初拒，后要求如有命案，子龙就要在宋慈面前验尸。子龙第一次验尸先遇上玉珠，后要带村姑路而所阻延，他不但迟到，更破坏现场证据及错漏百出，子龙所提的证据更被宋慈一一推翻，宋慈拒绝收子龙为徒，玉宝得知即嫌弃子龙。玉宝遇万福，万福被其天使面孔吸引。吕氏向子龙打探玉珠的过去，宋慈在旁大赞玉珠，子龙质问宋慈为何要撮合展杰与玉珠。丹凤欲开食店但苦无资本，得如梦相助。万福向玉宝家提亲，玉宝为钱决嫁给万福为平妻，更在子龙面前撒谎说为父还债，子龙苦劝无效更被打伤。丹凤扶着受伤的子龙到河边，子龙诉说玉宝对自己如何重要。
子龙在丹凤前自责不能拜宋慈为师未能出人头地，更不能帮玉宝还债，丹凤以自己儿时惨况激励子龙。子龙着丹凤代为守秘，但宋慈竟在粥店教训子龙，子龙以为丹凤多口，即老羞成怒大骂丹凤。其实宋慈在阮家门口已目睹一切，已知子龙拜师目的。如梦见两女孩行乞，更信她们被拐子佬利用，如梦将女孩事告知众捕快，众取笑如梦愚蠢，惟独展杰相信，如梦向展杰说自己因被掳而买买落青楼，所以格外同情女孩。展杰知如梦身世非常同情，二人互生好感。吕氏与秀娴欲撮合展杰与玉珠，二人皆感不目然。玉珠撞破展杰与如梦约会而得知二人交往，决为二人掩饰。玉珠找展杰出外时遇上宋慈，宋慈在玉珠前赞展杰，玉珠故意赞同激宋慈。展杰没空与如梦去查案，叫玉珠陪如梦，二人再遇两名女孩，遂跟踪她们，被拐子佬捉个正着，二女被绑架，匪徒向国色天香楼勒索，宋慈、展杰等大为紧张，叫丹凤扮做雪姨去交赎款，众捕快布下天罗地网活捉绑匪，岂料绑匪逃脱并捉了丹凤。子龙遇上匪徒偷运丹凤，子龙救丹凤而错手打死绑匪，绑匪临死前也不肯讲出二女下落，更说要她们陪葬。如梦、玉珠下落不明，众遍寻不获。玉珠以宋慈一定会救她们去激励绝望的如梦。宋慈不吃不休意图从匪尸找出二女藏身点的线索，为差点烧毁勒索信而大怒，焉知非福，竟得知匪徒藏身地在果园附近，众至一废屋，终发现二女藏身地，玉珠与如梦亦终于获救。
商人失踪，宋慈与众捕快遍寻尸体不获，宋慈以猫食物来提点子龙，子龙再从以火炉悟出寻尸的方法，终找到商人尸体。玉珠与丹凤在宋慈面前大赞子龙，原来宋慈有心让子龙大显身手，在众人怂恿下，宋慈终答允收子龙为徒，宋慈一再叮嘱徒弟不要懒散。香姑说丹凤明年姻缘会到，虽然会有波折但不失为好姻缘。丹凤向玉珠透露自己会与属龙的男子配成一对，后来子龙送了一疋布给丹凤，更得知子龙属龙，芳心大喜。子龙不小心将证物绳结扔掉，彷徨间遇见玉珠，玉珠自告奋勇为他找绳结，子龙见状非常感动。丹凤得知绳结在垃圾堆中，即不理污糟为子龙寻物，但却一无所获，玉珠与子龙终找到绳结，二人开心不已，反而丹凤弄得一身污糟却被子龙冷落一旁。宋慈要玉珠帮助自己重组案情，着子龙抱玉珠扮吊颈，当子龙抱着玉珠时竟有异样感觉。展杰与如梦在逛街，途中遇上嫖客调戏如梦，展杰与嫖客发生冲突，二人交往一事为展坚知道，他大力反对说欢场女子不会对人真心，展杰反驳，父子吵架收场。展杰欲替如梦赎身，但苦无一千两，展杰无奈。子龙与丹凤谈论展杰与如梦的事，借题发挥说向玉珠表白追求之意，丹凤得知自己无望即大为失望。子龙送玉珠手套并借意表白，但玉珠以为子龙开自己玩笑。
